Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB3

Thumpd2, THUMP domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd2Q9CZB3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Thumpd2Q9CZB3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Thumpd2Q9CZB3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Thumpd2Q9CZB3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Thumpd2Q9CZB3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Thumpd2Q9CZB3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Thumpd2Q9CZB3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Thumpd2Q9CZB3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Thumpd2Q9CZB3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Thumpd2Q9CZB3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Thumpd2Q9CZB3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Thumpd2Q9CZB3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Thumpd2Q9CZB3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Thumpd2Q9CZB3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Thumpd2Q9CZB3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Thumpd2Q9CZB3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Thumpd2Q9CZB3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Thumpd2Q9CZB3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Thumpd2Q9CZB3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Thumpd2Q9CZB3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Thumpd2Q9CZB3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Thumpd2Q9CZB3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Thumpd2Q9CZB3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Thumpd2Q9CZB3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Thumpd2Q9CZB3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Thumpd2Q9CZB3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Thumpd2Q9CZB3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Thumpd2Q9CZB3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Thumpd2Q9CZB3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Thumpd2Q9CZB3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Thumpd2Q9CZB3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Thumpd2Q9CZB3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Thumpd2Q9CZB3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Thumpd2Q9CZB3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Thumpd2Q9CZB3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Thumpd2Q9CZB3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Thumpd2Q9CZB3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Thumpd2Q9CZB3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Thumpd2Q9CZB3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Thumpd2Q9CZB3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Thumpd2Q9CZB3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Thumpd2Q9CZB3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Thumpd2Q9CZB3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Thumpd2Q9CZB3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Thumpd2Q9CZB3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Thumpd2Q9CZB3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Thumpd2Q9CZB3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Thumpd2Q9CZB3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Thumpd2Q9CZB3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Thumpd2Q9CZB3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Thumpd2Q9CZB3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Thumpd2Q9CZB3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Thumpd2Q9CZB3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Thumpd2Q9CZB3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Thumpd2Q9CZB3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Thumpd2Q9CZB3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Thumpd2Q9CZB3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Thumpd2Q9CZB3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Thumpd2Q9CZB3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Thumpd2Q9CZB3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Thumpd2Q9CZB3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Thumpd2Q9CZB3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Thumpd2Q9CZB3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Thumpd2Q9CZB3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Thumpd2Q9CZB3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Thumpd2Q9CZB3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Thumpd2Q9CZB3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Thumpd2Q9CZB3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Thumpd2Q9CZB3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Thumpd2Q9CZB3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Thumpd2Q9CZB3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Thumpd2Q9CZB3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Thumpd2Q9CZB3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Thumpd2Q9CZB3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Thumpd2Q9CZB3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Thumpd2Q9CZB3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Thumpd2Q9CZB3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Thumpd2Q9CZB3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Thumpd2Q9CZB3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Thumpd2Q9CZB3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Thumpd2Q9CZB3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Thumpd2Q9CZB3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Thumpd2Q9CZB3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Thumpd2Q9CZB3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Thumpd2Q9CZB3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Thumpd2Q9CZB3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Thumpd2Q9CZB3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Thumpd2Q9CZB3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Thumpd2Q9CZB3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Thumpd2Q9CZB3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Thumpd2Q9CZB3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Thumpd2Q9CZB3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Thumpd2Q9CZB3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Thumpd2Q9CZB3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Thumpd2Q9CZB3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Thumpd2Q9CZB3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Thumpd2Q9CZB3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Thumpd2Q9CZB3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Thumpd2Q9CZB3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Thumpd2Q9CZB3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 560.1 ms