Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PompQ9CQT5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PompQ9CQT5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PompQ9CQT5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PompQ9CQT5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PompQ9CQT5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PompQ9CQT5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PompQ9CQT5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PompQ9CQT5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PompQ9CQT5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PompQ9CQT5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PompQ9CQT5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PompQ9CQT5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PompQ9CQT5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PompQ9CQT5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PompQ9CQT5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PompQ9CQT5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PompQ9CQT5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PompQ9CQT5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PompQ9CQT5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PompQ9CQT5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PompQ9CQT5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PompQ9CQT5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PompQ9CQT5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PompQ9CQT5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PompQ9CQT5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PompQ9CQT5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PompQ9CQT5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PompQ9CQT5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PompQ9CQT5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PompQ9CQT5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PompQ9CQT5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PompQ9CQT5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PompQ9CQT5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PompQ9CQT5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PompQ9CQT5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PompQ9CQT5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PompQ9CQT5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PompQ9CQT5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PompQ9CQT5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PompQ9CQT5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PompQ9CQT5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PompQ9CQT5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PompQ9CQT5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PompQ9CQT5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PompQ9CQT5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PompQ9CQT5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PompQ9CQT5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PompQ9CQT5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PompQ9CQT5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PompQ9CQT5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PompQ9CQT5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PompQ9CQT5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PompQ9CQT5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PompQ9CQT5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PompQ9CQT5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PompQ9CQT5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PompQ9CQT5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PompQ9CQT5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PompQ9CQT5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PompQ9CQT5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PompQ9CQT5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PompQ9CQT5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PompQ9CQT5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PompQ9CQT5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PompQ9CQT5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PompQ9CQT5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PompQ9CQT5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PompQ9CQT5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PompQ9CQT5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PompQ9CQT5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PompQ9CQT5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PompQ9CQT5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PompQ9CQT5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PompQ9CQT5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PompQ9CQT5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PompQ9CQT5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PompQ9CQT5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PompQ9CQT5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PompQ9CQT5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PompQ9CQT5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PompQ9CQT5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PompQ9CQT5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PompQ9CQT5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PompQ9CQT5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PompQ9CQT5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PompQ9CQT5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PompQ9CQT5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PompQ9CQT5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PompQ9CQT5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PompQ9CQT5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PompQ9CQT5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PompQ9CQT5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PompQ9CQT5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PompQ9CQT5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PompQ9CQT5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PompQ9CQT5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PompQ9CQT5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PompQ9CQT5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PompQ9CQT5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.6 ms