Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR3

Slc12a9, Solute carrier family 12 member 9, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a9Q99MR3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc12a9Q99MR3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc12a9Q99MR3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slc12a9Q99MR3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc12a9Q99MR3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc12a9Q99MR3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc12a9Q99MR3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc12a9Q99MR3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc12a9Q99MR3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc12a9Q99MR3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc12a9Q99MR3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc12a9Q99MR3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc12a9Q99MR3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc12a9Q99MR3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc12a9Q99MR3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc12a9Q99MR3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc12a9Q99MR3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc12a9Q99MR3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc12a9Q99MR3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc12a9Q99MR3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc12a9Q99MR3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc12a9Q99MR3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc12a9Q99MR3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc12a9Q99MR3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc12a9Q99MR3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc12a9Q99MR3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc12a9Q99MR3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc12a9Q99MR3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc12a9Q99MR3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc12a9Q99MR3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc12a9Q99MR3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc12a9Q99MR3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc12a9Q99MR3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc12a9Q99MR3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc12a9Q99MR3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc12a9Q99MR3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc12a9Q99MR3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc12a9Q99MR3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc12a9Q99MR3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc12a9Q99MR3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc12a9Q99MR3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc12a9Q99MR3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc12a9Q99MR3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc12a9Q99MR3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc12a9Q99MR3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc12a9Q99MR3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc12a9Q99MR3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc12a9Q99MR3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc12a9Q99MR3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc12a9Q99MR3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc12a9Q99MR3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc12a9Q99MR3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc12a9Q99MR3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc12a9Q99MR3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc12a9Q99MR3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc12a9Q99MR3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc12a9Q99MR3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc12a9Q99MR3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc12a9Q99MR3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc12a9Q99MR3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc12a9Q99MR3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc12a9Q99MR3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc12a9Q99MR3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc12a9Q99MR3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc12a9Q99MR3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc12a9Q99MR3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc12a9Q99MR3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc12a9Q99MR3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc12a9Q99MR3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc12a9Q99MR3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc12a9Q99MR3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc12a9Q99MR3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc12a9Q99MR3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc12a9Q99MR3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc12a9Q99MR3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc12a9Q99MR3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc12a9Q99MR3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc12a9Q99MR3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc12a9Q99MR3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc12a9Q99MR3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc12a9Q99MR3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc12a9Q99MR3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc12a9Q99MR3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc12a9Q99MR3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc12a9Q99MR3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc12a9Q99MR3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc12a9Q99MR3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Slc12a9Q99MR3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Slc12a9Q99MR3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc12a9Q99MR3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc12a9Q99MR3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc12a9Q99MR3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc12a9Q99MR3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc12a9Q99MR3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc12a9Q99MR3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc12a9Q99MR3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc12a9Q99MR3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc12a9Q99MR3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc12a9Q99MR3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc12a9Q99MR3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms