Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gdpd3Q99LY2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gdpd3Q99LY2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gdpd3Q99LY2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gdpd3Q99LY2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gdpd3Q99LY2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gdpd3Q99LY2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gdpd3Q99LY2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gdpd3Q99LY2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gdpd3Q99LY2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gdpd3Q99LY2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gdpd3Q99LY2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gdpd3Q99LY2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gdpd3Q99LY2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gdpd3Q99LY2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gdpd3Q99LY2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gdpd3Q99LY2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gdpd3Q99LY2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gdpd3Q99LY2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gdpd3Q99LY2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gdpd3Q99LY2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gdpd3Q99LY2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gdpd3Q99LY2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gdpd3Q99LY2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Gdpd3Q99LY2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Gdpd3Q99LY2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gdpd3Q99LY2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gdpd3Q99LY2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gdpd3Q99LY2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gdpd3Q99LY2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gdpd3Q99LY2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gdpd3Q99LY2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gdpd3Q99LY2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gdpd3Q99LY2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gdpd3Q99LY2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gdpd3Q99LY2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gdpd3Q99LY2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gdpd3Q99LY2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gdpd3Q99LY2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gdpd3Q99LY2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gdpd3Q99LY2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gdpd3Q99LY2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gdpd3Q99LY2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gdpd3Q99LY2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gdpd3Q99LY2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gdpd3Q99LY2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gdpd3Q99LY2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gdpd3Q99LY2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gdpd3Q99LY2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gdpd3Q99LY2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gdpd3Q99LY2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gdpd3Q99LY2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gdpd3Q99LY2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gdpd3Q99LY2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gdpd3Q99LY2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gdpd3Q99LY2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gdpd3Q99LY2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gdpd3Q99LY2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gdpd3Q99LY2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gdpd3Q99LY2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gdpd3Q99LY2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Gdpd3Q99LY2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gdpd3Q99LY2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gdpd3Q99LY2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gdpd3Q99LY2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gdpd3Q99LY2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gdpd3Q99LY2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gdpd3Q99LY2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gdpd3Q99LY2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gdpd3Q99LY2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gdpd3Q99LY2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gdpd3Q99LY2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gdpd3Q99LY2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gdpd3Q99LY2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gdpd3Q99LY2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gdpd3Q99LY2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gdpd3Q99LY2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gdpd3Q99LY2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Gdpd3Q99LY2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Gdpd3Q99LY2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gdpd3Q99LY2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gdpd3Q99LY2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gdpd3Q99LY2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gdpd3Q99LY2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gdpd3Q99LY2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gdpd3Q99LY2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gdpd3Q99LY2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gdpd3Q99LY2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gdpd3Q99LY2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gdpd3Q99LY2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Gdpd3Q99LY2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gdpd3Q99LY2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gdpd3Q99LY2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Gdpd3Q99LY2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gdpd3Q99LY2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gdpd3Q99LY2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Gdpd3Q99LY2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gdpd3Q99LY2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gdpd3Q99LY2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gdpd3Q99LY2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms