Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hps4Q99KG7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hps4Q99KG7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hps4Q99KG7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hps4Q99KG7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hps4Q99KG7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Hps4Q99KG7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hps4Q99KG7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hps4Q99KG7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Hps4Q99KG7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Hps4Q99KG7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hps4Q99KG7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hps4Q99KG7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hps4Q99KG7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hps4Q99KG7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hps4Q99KG7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hps4Q99KG7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hps4Q99KG7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hps4Q99KG7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hps4Q99KG7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Hps4Q99KG7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Hps4Q99KG7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hps4Q99KG7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hps4Q99KG7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Hps4Q99KG7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hps4Q99KG7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hps4Q99KG7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Hps4Q99KG7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hps4Q99KG7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hps4Q99KG7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hps4Q99KG7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hps4Q99KG7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hps4Q99KG7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hps4Q99KG7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hps4Q99KG7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hps4Q99KG7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hps4Q99KG7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hps4Q99KG7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hps4Q99KG7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hps4Q99KG7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hps4Q99KG7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hps4Q99KG7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hps4Q99KG7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hps4Q99KG7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hps4Q99KG7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hps4Q99KG7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hps4Q99KG7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hps4Q99KG7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hps4Q99KG7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hps4Q99KG7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Hps4Q99KG7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hps4Q99KG7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hps4Q99KG7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hps4Q99KG7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hps4Q99KG7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hps4Q99KG7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hps4Q99KG7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hps4Q99KG7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hps4Q99KG7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hps4Q99KG7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hps4Q99KG7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hps4Q99KG7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hps4Q99KG7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hps4Q99KG7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Hps4Q99KG7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hps4Q99KG7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hps4Q99KG7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hps4Q99KG7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hps4Q99KG7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hps4Q99KG7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hps4Q99KG7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hps4Q99KG7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hps4Q99KG7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hps4Q99KG7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hps4Q99KG7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hps4Q99KG7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hps4Q99KG7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hps4Q99KG7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hps4Q99KG7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hps4Q99KG7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hps4Q99KG7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hps4Q99KG7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hps4Q99KG7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hps4Q99KG7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hps4Q99KG7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hps4Q99KG7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hps4Q99KG7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hps4Q99KG7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hps4Q99KG7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hps4Q99KG7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hps4Q99KG7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hps4Q99KG7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hps4Q99KG7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Hps4Q99KG7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hps4Q99KG7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hps4Q99KG7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hps4Q99KG7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hps4Q99KG7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hps4Q99KG7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hps4Q99KG7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms