Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TrabdQ99JY4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TrabdQ99JY4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TrabdQ99JY4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TrabdQ99JY4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TrabdQ99JY4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TrabdQ99JY4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TrabdQ99JY4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TrabdQ99JY4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TrabdQ99JY4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TrabdQ99JY4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TrabdQ99JY4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TrabdQ99JY4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TrabdQ99JY4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TrabdQ99JY4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TrabdQ99JY4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TrabdQ99JY4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TrabdQ99JY4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TrabdQ99JY4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TrabdQ99JY4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TrabdQ99JY4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TrabdQ99JY4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TrabdQ99JY4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TrabdQ99JY4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TrabdQ99JY4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TrabdQ99JY4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TrabdQ99JY4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TrabdQ99JY4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TrabdQ99JY4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TrabdQ99JY4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TrabdQ99JY4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TrabdQ99JY4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TrabdQ99JY4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TrabdQ99JY4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TrabdQ99JY4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TrabdQ99JY4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TrabdQ99JY4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TrabdQ99JY4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TrabdQ99JY4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TrabdQ99JY4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TrabdQ99JY4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TrabdQ99JY4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TrabdQ99JY4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TrabdQ99JY4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TrabdQ99JY4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TrabdQ99JY4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TrabdQ99JY4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TrabdQ99JY4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TrabdQ99JY4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TrabdQ99JY4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TrabdQ99JY4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TrabdQ99JY4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TrabdQ99JY4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TrabdQ99JY4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TrabdQ99JY4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TrabdQ99JY4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TrabdQ99JY4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TrabdQ99JY4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TrabdQ99JY4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TrabdQ99JY4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TrabdQ99JY4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TrabdQ99JY4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TrabdQ99JY4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TrabdQ99JY4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TrabdQ99JY4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TrabdQ99JY4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TrabdQ99JY4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TrabdQ99JY4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TrabdQ99JY4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TrabdQ99JY4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TrabdQ99JY4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TrabdQ99JY4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TrabdQ99JY4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TrabdQ99JY4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TrabdQ99JY4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TrabdQ99JY4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TrabdQ99JY4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TrabdQ99JY4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TrabdQ99JY4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TrabdQ99JY4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TrabdQ99JY4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TrabdQ99JY4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TrabdQ99JY4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TrabdQ99JY4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TrabdQ99JY4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TrabdQ99JY4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TrabdQ99JY4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TrabdQ99JY4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TrabdQ99JY4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TrabdQ99JY4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TrabdQ99JY4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TrabdQ99JY4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TrabdQ99JY4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TrabdQ99JY4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TrabdQ99JY4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TrabdQ99JY4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TrabdQ99JY4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TrabdQ99JY4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TrabdQ99JY4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TrabdQ99JY4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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