Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Pacsin3Q99JB8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pacsin3Q99JB8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pacsin3Q99JB8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pacsin3Q99JB8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Pacsin3Q99JB8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Pacsin3Q99JB8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pacsin3Q99JB8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pacsin3Q99JB8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pacsin3Q99JB8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pacsin3Q99JB8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pacsin3Q99JB8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pacsin3Q99JB8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pacsin3Q99JB8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pacsin3Q99JB8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pacsin3Q99JB8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pacsin3Q99JB8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pacsin3Q99JB8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pacsin3Q99JB8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pacsin3Q99JB8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pacsin3Q99JB8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pacsin3Q99JB8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pacsin3Q99JB8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pacsin3Q99JB8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pacsin3Q99JB8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pacsin3Q99JB8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pacsin3Q99JB8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pacsin3Q99JB8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pacsin3Q99JB8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pacsin3Q99JB8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pacsin3Q99JB8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pacsin3Q99JB8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pacsin3Q99JB8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Pacsin3Q99JB8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pacsin3Q99JB8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pacsin3Q99JB8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pacsin3Q99JB8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pacsin3Q99JB8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pacsin3Q99JB8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pacsin3Q99JB8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pacsin3Q99JB8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pacsin3Q99JB8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pacsin3Q99JB8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pacsin3Q99JB8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pacsin3Q99JB8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pacsin3Q99JB8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pacsin3Q99JB8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pacsin3Q99JB8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pacsin3Q99JB8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pacsin3Q99JB8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pacsin3Q99JB8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pacsin3Q99JB8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pacsin3Q99JB8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pacsin3Q99JB8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pacsin3Q99JB8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pacsin3Q99JB8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pacsin3Q99JB8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pacsin3Q99JB8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pacsin3Q99JB8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pacsin3Q99JB8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pacsin3Q99JB8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pacsin3Q99JB8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pacsin3Q99JB8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pacsin3Q99JB8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pacsin3Q99JB8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pacsin3Q99JB8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pacsin3Q99JB8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pacsin3Q99JB8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pacsin3Q99JB8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pacsin3Q99JB8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pacsin3Q99JB8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pacsin3Q99JB8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pacsin3Q99JB8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Pacsin3Q99JB8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pacsin3Q99JB8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pacsin3Q99JB8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pacsin3Q99JB8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pacsin3Q99JB8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pacsin3Q99JB8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pacsin3Q99JB8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pacsin3Q99JB8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pacsin3Q99JB8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pacsin3Q99JB8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pacsin3Q99JB8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pacsin3Q99JB8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pacsin3Q99JB8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pacsin3Q99JB8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pacsin3Q99JB8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pacsin3Q99JB8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pacsin3Q99JB8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pacsin3Q99JB8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pacsin3Q99JB8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pacsin3Q99JB8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pacsin3Q99JB8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pacsin3Q99JB8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pacsin3Q99JB8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pacsin3Q99JB8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pacsin3Q99JB8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pacsin3Q99JB8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pacsin3Q99JB8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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