Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4C2

Rufy2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy2Q8R4C2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rufy2Q8R4C2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rufy2Q8R4C2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rufy2Q8R4C2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rufy2Q8R4C2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rufy2Q8R4C2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rufy2Q8R4C2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Rufy2Q8R4C2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rufy2Q8R4C2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rufy2Q8R4C2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rufy2Q8R4C2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rufy2Q8R4C2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Rufy2Q8R4C2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rufy2Q8R4C2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rufy2Q8R4C2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rufy2Q8R4C2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rufy2Q8R4C2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rufy2Q8R4C2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rufy2Q8R4C2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rufy2Q8R4C2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rufy2Q8R4C2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rufy2Q8R4C2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rufy2Q8R4C2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rufy2Q8R4C2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rufy2Q8R4C2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rufy2Q8R4C2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rufy2Q8R4C2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rufy2Q8R4C2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rufy2Q8R4C2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rufy2Q8R4C2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rufy2Q8R4C2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rufy2Q8R4C2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rufy2Q8R4C2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rufy2Q8R4C2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rufy2Q8R4C2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rufy2Q8R4C2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rufy2Q8R4C2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rufy2Q8R4C2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rufy2Q8R4C2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rufy2Q8R4C2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rufy2Q8R4C2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rufy2Q8R4C2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rufy2Q8R4C2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rufy2Q8R4C2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Rufy2Q8R4C2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rufy2Q8R4C2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Rufy2Q8R4C2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rufy2Q8R4C2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rufy2Q8R4C2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rufy2Q8R4C2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rufy2Q8R4C2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rufy2Q8R4C2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rufy2Q8R4C2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rufy2Q8R4C2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Rufy2Q8R4C2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rufy2Q8R4C2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rufy2Q8R4C2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rufy2Q8R4C2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rufy2Q8R4C2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rufy2Q8R4C2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rufy2Q8R4C2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rufy2Q8R4C2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rufy2Q8R4C2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rufy2Q8R4C2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rufy2Q8R4C2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rufy2Q8R4C2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rufy2Q8R4C2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rufy2Q8R4C2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rufy2Q8R4C2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Rufy2Q8R4C2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rufy2Q8R4C2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rufy2Q8R4C2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rufy2Q8R4C2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rufy2Q8R4C2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rufy2Q8R4C2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rufy2Q8R4C2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rufy2Q8R4C2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rufy2Q8R4C2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rufy2Q8R4C2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rufy2Q8R4C2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rufy2Q8R4C2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rufy2Q8R4C2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rufy2Q8R4C2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rufy2Q8R4C2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rufy2Q8R4C2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rufy2Q8R4C2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rufy2Q8R4C2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rufy2Q8R4C2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rufy2Q8R4C2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rufy2Q8R4C2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rufy2Q8R4C2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rufy2Q8R4C2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rufy2Q8R4C2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rufy2Q8R4C2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rufy2Q8R4C2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rufy2Q8R4C2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rufy2Q8R4C2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rufy2Q8R4C2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rufy2Q8R4C2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rufy2Q8R4C2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms