Protein–RNA interactions for Protein: Q8K203

Neil3, Endonuclease 8-like 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil3Q8K203 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Neil3Q8K203 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Neil3Q8K203 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Neil3Q8K203 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Neil3Q8K203 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Neil3Q8K203 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Neil3Q8K203 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Neil3Q8K203 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Neil3Q8K203 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Neil3Q8K203 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Neil3Q8K203 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Neil3Q8K203 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Neil3Q8K203 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Neil3Q8K203 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Neil3Q8K203 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Neil3Q8K203 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Neil3Q8K203 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Neil3Q8K203 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Neil3Q8K203 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Neil3Q8K203 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Neil3Q8K203 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Neil3Q8K203 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Neil3Q8K203 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Neil3Q8K203 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Neil3Q8K203 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Neil3Q8K203 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Neil3Q8K203 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Neil3Q8K203 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Neil3Q8K203 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Neil3Q8K203 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Neil3Q8K203 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Neil3Q8K203 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Neil3Q8K203 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Neil3Q8K203 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Neil3Q8K203 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Neil3Q8K203 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Neil3Q8K203 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Neil3Q8K203 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Neil3Q8K203 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Neil3Q8K203 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Neil3Q8K203 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Neil3Q8K203 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Neil3Q8K203 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Neil3Q8K203 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Neil3Q8K203 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Neil3Q8K203 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Neil3Q8K203 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Neil3Q8K203 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Neil3Q8K203 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Neil3Q8K203 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Neil3Q8K203 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Neil3Q8K203 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Neil3Q8K203 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Neil3Q8K203 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Neil3Q8K203 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Neil3Q8K203 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Neil3Q8K203 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Neil3Q8K203 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Neil3Q8K203 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Neil3Q8K203 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Neil3Q8K203 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Neil3Q8K203 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Neil3Q8K203 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Neil3Q8K203 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Neil3Q8K203 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Neil3Q8K203 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Neil3Q8K203 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Neil3Q8K203 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Neil3Q8K203 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Neil3Q8K203 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Neil3Q8K203 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Neil3Q8K203 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Neil3Q8K203 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Neil3Q8K203 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Neil3Q8K203 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Neil3Q8K203 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Neil3Q8K203 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Neil3Q8K203 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Neil3Q8K203 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Neil3Q8K203 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Neil3Q8K203 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Neil3Q8K203 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Neil3Q8K203 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Neil3Q8K203 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Neil3Q8K203 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Neil3Q8K203 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Neil3Q8K203 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Neil3Q8K203 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Neil3Q8K203 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Neil3Q8K203 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Neil3Q8K203 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Neil3Q8K203 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Neil3Q8K203 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Neil3Q8K203 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Neil3Q8K203 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Neil3Q8K203 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Neil3Q8K203 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Neil3Q8K203 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Neil3Q8K203 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Neil3Q8K203 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms