Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nek9Q8K1R7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nek9Q8K1R7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nek9Q8K1R7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nek9Q8K1R7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nek9Q8K1R7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nek9Q8K1R7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nek9Q8K1R7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nek9Q8K1R7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nek9Q8K1R7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nek9Q8K1R7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nek9Q8K1R7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nek9Q8K1R7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nek9Q8K1R7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nek9Q8K1R7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Nek9Q8K1R7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nek9Q8K1R7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nek9Q8K1R7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nek9Q8K1R7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nek9Q8K1R7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Nek9Q8K1R7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nek9Q8K1R7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nek9Q8K1R7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nek9Q8K1R7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nek9Q8K1R7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nek9Q8K1R7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nek9Q8K1R7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nek9Q8K1R7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nek9Q8K1R7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nek9Q8K1R7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nek9Q8K1R7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nek9Q8K1R7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nek9Q8K1R7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nek9Q8K1R7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nek9Q8K1R7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nek9Q8K1R7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nek9Q8K1R7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nek9Q8K1R7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nek9Q8K1R7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nek9Q8K1R7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Nek9Q8K1R7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nek9Q8K1R7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nek9Q8K1R7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nek9Q8K1R7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nek9Q8K1R7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nek9Q8K1R7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nek9Q8K1R7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nek9Q8K1R7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nek9Q8K1R7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nek9Q8K1R7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nek9Q8K1R7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nek9Q8K1R7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nek9Q8K1R7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nek9Q8K1R7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nek9Q8K1R7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nek9Q8K1R7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nek9Q8K1R7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nek9Q8K1R7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Nek9Q8K1R7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nek9Q8K1R7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nek9Q8K1R7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nek9Q8K1R7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nek9Q8K1R7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Nek9Q8K1R7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Nek9Q8K1R7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nek9Q8K1R7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nek9Q8K1R7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nek9Q8K1R7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nek9Q8K1R7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nek9Q8K1R7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nek9Q8K1R7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nek9Q8K1R7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nek9Q8K1R7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nek9Q8K1R7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nek9Q8K1R7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nek9Q8K1R7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nek9Q8K1R7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nek9Q8K1R7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nek9Q8K1R7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nek9Q8K1R7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nek9Q8K1R7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nek9Q8K1R7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nek9Q8K1R7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nek9Q8K1R7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nek9Q8K1R7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Nek9Q8K1R7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nek9Q8K1R7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nek9Q8K1R7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nek9Q8K1R7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nek9Q8K1R7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nek9Q8K1R7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nek9Q8K1R7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nek9Q8K1R7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nek9Q8K1R7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nek9Q8K1R7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nek9Q8K1R7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nek9Q8K1R7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nek9Q8K1R7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Nek9Q8K1R7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nek9Q8K1R7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms