Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Cldn34c1Q8K193 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cldn34c1Q8K193 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cldn34c1Q8K193 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34c1Q8K193 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34c1Q8K193 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34c1Q8K193 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Cldn34c1Q8K193 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34c1Q8K193 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34c1Q8K193 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34c1Q8K193 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34c1Q8K193 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34c1Q8K193 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34c1Q8K193 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34c1Q8K193 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34c1Q8K193 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34c1Q8K193 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34c1Q8K193 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34c1Q8K193 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34c1Q8K193 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34c1Q8K193 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34c1Q8K193 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34c1Q8K193 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34c1Q8K193 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34c1Q8K193 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Cldn34c1Q8K193 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34c1Q8K193 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Cldn34c1Q8K193 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn34c1Q8K193 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Cldn34c1Q8K193 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn34c1Q8K193 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Cldn34c1Q8K193 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn34c1Q8K193 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Cldn34c1Q8K193 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn34c1Q8K193 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Cldn34c1Q8K193 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Cldn34c1Q8K193 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Cldn34c1Q8K193 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Cldn34c1Q8K193 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Cldn34c1Q8K193 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34c1Q8K193 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Cldn34c1Q8K193 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Cldn34c1Q8K193 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34c1Q8K193 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34c1Q8K193 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34c1Q8K193 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34c1Q8K193 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Cldn34c1Q8K193 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Cldn34c1Q8K193 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn34c1Q8K193 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn34c1Q8K193 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn34c1Q8K193 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn34c1Q8K193 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn34c1Q8K193 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn34c1Q8K193 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn34c1Q8K193 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn34c1Q8K193 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn34c1Q8K193 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn34c1Q8K193 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn34c1Q8K193 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn34c1Q8K193 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn34c1Q8K193 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Cldn34c1Q8K193 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn34c1Q8K193 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms