Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CopaQ8CIE6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CopaQ8CIE6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CopaQ8CIE6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CopaQ8CIE6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CopaQ8CIE6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CopaQ8CIE6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CopaQ8CIE6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CopaQ8CIE6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CopaQ8CIE6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CopaQ8CIE6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CopaQ8CIE6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CopaQ8CIE6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CopaQ8CIE6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CopaQ8CIE6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CopaQ8CIE6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CopaQ8CIE6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CopaQ8CIE6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CopaQ8CIE6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CopaQ8CIE6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CopaQ8CIE6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CopaQ8CIE6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CopaQ8CIE6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CopaQ8CIE6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CopaQ8CIE6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CopaQ8CIE6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CopaQ8CIE6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CopaQ8CIE6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CopaQ8CIE6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CopaQ8CIE6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CopaQ8CIE6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CopaQ8CIE6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CopaQ8CIE6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CopaQ8CIE6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CopaQ8CIE6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CopaQ8CIE6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CopaQ8CIE6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CopaQ8CIE6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CopaQ8CIE6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CopaQ8CIE6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CopaQ8CIE6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CopaQ8CIE6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CopaQ8CIE6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CopaQ8CIE6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CopaQ8CIE6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CopaQ8CIE6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CopaQ8CIE6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CopaQ8CIE6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CopaQ8CIE6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CopaQ8CIE6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CopaQ8CIE6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CopaQ8CIE6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CopaQ8CIE6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CopaQ8CIE6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CopaQ8CIE6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CopaQ8CIE6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CopaQ8CIE6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CopaQ8CIE6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CopaQ8CIE6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CopaQ8CIE6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CopaQ8CIE6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CopaQ8CIE6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CopaQ8CIE6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CopaQ8CIE6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CopaQ8CIE6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CopaQ8CIE6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CopaQ8CIE6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CopaQ8CIE6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CopaQ8CIE6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CopaQ8CIE6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CopaQ8CIE6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CopaQ8CIE6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CopaQ8CIE6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CopaQ8CIE6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CopaQ8CIE6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CopaQ8CIE6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CopaQ8CIE6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CopaQ8CIE6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CopaQ8CIE6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CopaQ8CIE6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CopaQ8CIE6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CopaQ8CIE6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CopaQ8CIE6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CopaQ8CIE6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CopaQ8CIE6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CopaQ8CIE6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CopaQ8CIE6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CopaQ8CIE6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CopaQ8CIE6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CopaQ8CIE6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CopaQ8CIE6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CopaQ8CIE6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CopaQ8CIE6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CopaQ8CIE6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CopaQ8CIE6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CopaQ8CIE6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CopaQ8CIE6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CopaQ8CIE6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CopaQ8CIE6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CopaQ8CIE6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110 ms