Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc38Q8CDN8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc38Q8CDN8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc38Q8CDN8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc38Q8CDN8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc38Q8CDN8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc38Q8CDN8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc38Q8CDN8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc38Q8CDN8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc38Q8CDN8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc38Q8CDN8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc38Q8CDN8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc38Q8CDN8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc38Q8CDN8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc38Q8CDN8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc38Q8CDN8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc38Q8CDN8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc38Q8CDN8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc38Q8CDN8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc38Q8CDN8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc38Q8CDN8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc38Q8CDN8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc38Q8CDN8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc38Q8CDN8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc38Q8CDN8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc38Q8CDN8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc38Q8CDN8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc38Q8CDN8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc38Q8CDN8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc38Q8CDN8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc38Q8CDN8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc38Q8CDN8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc38Q8CDN8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc38Q8CDN8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc38Q8CDN8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc38Q8CDN8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc38Q8CDN8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc38Q8CDN8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc38Q8CDN8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc38Q8CDN8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc38Q8CDN8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc38Q8CDN8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc38Q8CDN8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc38Q8CDN8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc38Q8CDN8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc38Q8CDN8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc38Q8CDN8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc38Q8CDN8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc38Q8CDN8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc38Q8CDN8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc38Q8CDN8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc38Q8CDN8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc38Q8CDN8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc38Q8CDN8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc38Q8CDN8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc38Q8CDN8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc38Q8CDN8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc38Q8CDN8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc38Q8CDN8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc38Q8CDN8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc38Q8CDN8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc38Q8CDN8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc38Q8CDN8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc38Q8CDN8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc38Q8CDN8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc38Q8CDN8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc38Q8CDN8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc38Q8CDN8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc38Q8CDN8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc38Q8CDN8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc38Q8CDN8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc38Q8CDN8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc38Q8CDN8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc38Q8CDN8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc38Q8CDN8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc38Q8CDN8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc38Q8CDN8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc38Q8CDN8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc38Q8CDN8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc38Q8CDN8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc38Q8CDN8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc38Q8CDN8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc38Q8CDN8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc38Q8CDN8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc38Q8CDN8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc38Q8CDN8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc38Q8CDN8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc38Q8CDN8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc38Q8CDN8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc38Q8CDN8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc38Q8CDN8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc38Q8CDN8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc38Q8CDN8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc38Q8CDN8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc38Q8CDN8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc38Q8CDN8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc38Q8CDN8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc38Q8CDN8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc38Q8CDN8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc38Q8CDN8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms