Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD33

6030452D12Rik, RIKEN cDNA 6030452D12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030452D12RikQ8CD33 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
6030452D12RikQ8CD33 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
6030452D12RikQ8CD33 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
6030452D12RikQ8CD33 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
6030452D12RikQ8CD33 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
6030452D12RikQ8CD33 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
6030452D12RikQ8CD33 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
6030452D12RikQ8CD33 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
6030452D12RikQ8CD33 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
6030452D12RikQ8CD33 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
6030452D12RikQ8CD33 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
6030452D12RikQ8CD33 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
6030452D12RikQ8CD33 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
6030452D12RikQ8CD33 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
6030452D12RikQ8CD33 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
6030452D12RikQ8CD33 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
6030452D12RikQ8CD33 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
6030452D12RikQ8CD33 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
6030452D12RikQ8CD33 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
6030452D12RikQ8CD33 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
6030452D12RikQ8CD33 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
6030452D12RikQ8CD33 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
6030452D12RikQ8CD33 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
6030452D12RikQ8CD33 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
6030452D12RikQ8CD33 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
6030452D12RikQ8CD33 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
6030452D12RikQ8CD33 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
6030452D12RikQ8CD33 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
6030452D12RikQ8CD33 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
6030452D12RikQ8CD33 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
6030452D12RikQ8CD33 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
6030452D12RikQ8CD33 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
6030452D12RikQ8CD33 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
6030452D12RikQ8CD33 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
6030452D12RikQ8CD33 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
6030452D12RikQ8CD33 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
6030452D12RikQ8CD33 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
6030452D12RikQ8CD33 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
6030452D12RikQ8CD33 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
6030452D12RikQ8CD33 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
6030452D12RikQ8CD33 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
6030452D12RikQ8CD33 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
6030452D12RikQ8CD33 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
6030452D12RikQ8CD33 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
6030452D12RikQ8CD33 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
6030452D12RikQ8CD33 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
6030452D12RikQ8CD33 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
6030452D12RikQ8CD33 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
6030452D12RikQ8CD33 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
6030452D12RikQ8CD33 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
6030452D12RikQ8CD33 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
6030452D12RikQ8CD33 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
6030452D12RikQ8CD33 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
6030452D12RikQ8CD33 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
6030452D12RikQ8CD33 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
6030452D12RikQ8CD33 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
6030452D12RikQ8CD33 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
6030452D12RikQ8CD33 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
6030452D12RikQ8CD33 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
6030452D12RikQ8CD33 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
6030452D12RikQ8CD33 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
6030452D12RikQ8CD33 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
6030452D12RikQ8CD33 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
6030452D12RikQ8CD33 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
6030452D12RikQ8CD33 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
6030452D12RikQ8CD33 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
6030452D12RikQ8CD33 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
6030452D12RikQ8CD33 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
6030452D12RikQ8CD33 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
6030452D12RikQ8CD33 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
6030452D12RikQ8CD33 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
6030452D12RikQ8CD33 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
6030452D12RikQ8CD33 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
6030452D12RikQ8CD33 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
6030452D12RikQ8CD33 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
6030452D12RikQ8CD33 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
6030452D12RikQ8CD33 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
6030452D12RikQ8CD33 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
6030452D12RikQ8CD33 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
6030452D12RikQ8CD33 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
6030452D12RikQ8CD33 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
6030452D12RikQ8CD33 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
6030452D12RikQ8CD33 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
6030452D12RikQ8CD33 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
6030452D12RikQ8CD33 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms