Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMG1

Atrip, ATR-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtripQ8BMG1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
AtripQ8BMG1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AtripQ8BMG1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AtripQ8BMG1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AtripQ8BMG1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AtripQ8BMG1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AtripQ8BMG1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AtripQ8BMG1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
AtripQ8BMG1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AtripQ8BMG1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AtripQ8BMG1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AtripQ8BMG1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AtripQ8BMG1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AtripQ8BMG1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AtripQ8BMG1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AtripQ8BMG1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
AtripQ8BMG1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
AtripQ8BMG1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AtripQ8BMG1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AtripQ8BMG1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AtripQ8BMG1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
AtripQ8BMG1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AtripQ8BMG1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AtripQ8BMG1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AtripQ8BMG1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AtripQ8BMG1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AtripQ8BMG1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AtripQ8BMG1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AtripQ8BMG1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AtripQ8BMG1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AtripQ8BMG1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AtripQ8BMG1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AtripQ8BMG1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
AtripQ8BMG1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AtripQ8BMG1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AtripQ8BMG1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AtripQ8BMG1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AtripQ8BMG1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AtripQ8BMG1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AtripQ8BMG1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AtripQ8BMG1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
AtripQ8BMG1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AtripQ8BMG1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AtripQ8BMG1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AtripQ8BMG1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AtripQ8BMG1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AtripQ8BMG1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
AtripQ8BMG1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AtripQ8BMG1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AtripQ8BMG1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AtripQ8BMG1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AtripQ8BMG1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AtripQ8BMG1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AtripQ8BMG1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AtripQ8BMG1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AtripQ8BMG1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AtripQ8BMG1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AtripQ8BMG1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AtripQ8BMG1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
AtripQ8BMG1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AtripQ8BMG1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AtripQ8BMG1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AtripQ8BMG1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AtripQ8BMG1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AtripQ8BMG1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AtripQ8BMG1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AtripQ8BMG1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AtripQ8BMG1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AtripQ8BMG1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AtripQ8BMG1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AtripQ8BMG1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AtripQ8BMG1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AtripQ8BMG1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AtripQ8BMG1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
AtripQ8BMG1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AtripQ8BMG1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AtripQ8BMG1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AtripQ8BMG1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
AtripQ8BMG1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AtripQ8BMG1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AtripQ8BMG1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AtripQ8BMG1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AtripQ8BMG1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AtripQ8BMG1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AtripQ8BMG1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AtripQ8BMG1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AtripQ8BMG1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AtripQ8BMG1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AtripQ8BMG1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AtripQ8BMG1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AtripQ8BMG1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AtripQ8BMG1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AtripQ8BMG1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AtripQ8BMG1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AtripQ8BMG1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AtripQ8BMG1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AtripQ8BMG1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AtripQ8BMG1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AtripQ8BMG1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AtripQ8BMG1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms