Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ChfrQ810L3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ChfrQ810L3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ChfrQ810L3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ChfrQ810L3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ChfrQ810L3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ChfrQ810L3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ChfrQ810L3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ChfrQ810L3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ChfrQ810L3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ChfrQ810L3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ChfrQ810L3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ChfrQ810L3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ChfrQ810L3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ChfrQ810L3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ChfrQ810L3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ChfrQ810L3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ChfrQ810L3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ChfrQ810L3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ChfrQ810L3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ChfrQ810L3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ChfrQ810L3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ChfrQ810L3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ChfrQ810L3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ChfrQ810L3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ChfrQ810L3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ChfrQ810L3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ChfrQ810L3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ChfrQ810L3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ChfrQ810L3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ChfrQ810L3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ChfrQ810L3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ChfrQ810L3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ChfrQ810L3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ChfrQ810L3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ChfrQ810L3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ChfrQ810L3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ChfrQ810L3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
ChfrQ810L3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ChfrQ810L3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ChfrQ810L3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ChfrQ810L3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ChfrQ810L3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ChfrQ810L3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ChfrQ810L3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ChfrQ810L3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ChfrQ810L3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ChfrQ810L3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ChfrQ810L3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ChfrQ810L3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ChfrQ810L3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ChfrQ810L3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ChfrQ810L3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ChfrQ810L3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ChfrQ810L3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ChfrQ810L3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ChfrQ810L3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ChfrQ810L3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ChfrQ810L3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ChfrQ810L3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ChfrQ810L3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ChfrQ810L3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ChfrQ810L3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ChfrQ810L3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ChfrQ810L3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ChfrQ810L3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ChfrQ810L3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ChfrQ810L3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ChfrQ810L3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ChfrQ810L3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ChfrQ810L3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ChfrQ810L3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ChfrQ810L3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ChfrQ810L3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ChfrQ810L3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ChfrQ810L3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ChfrQ810L3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ChfrQ810L3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ChfrQ810L3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ChfrQ810L3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ChfrQ810L3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ChfrQ810L3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ChfrQ810L3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ChfrQ810L3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ChfrQ810L3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ChfrQ810L3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ChfrQ810L3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ChfrQ810L3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ChfrQ810L3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ChfrQ810L3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ChfrQ810L3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ChfrQ810L3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ChfrQ810L3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ChfrQ810L3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ChfrQ810L3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ChfrQ810L3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ChfrQ810L3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ChfrQ810L3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ChfrQ810L3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ChfrQ810L3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
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