Protein–RNA interactions for Protein: Q80VW5

Whrn, Whirlin, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WhrnQ80VW5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
WhrnQ80VW5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
WhrnQ80VW5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WhrnQ80VW5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
WhrnQ80VW5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WhrnQ80VW5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WhrnQ80VW5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WhrnQ80VW5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WhrnQ80VW5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WhrnQ80VW5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
WhrnQ80VW5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WhrnQ80VW5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
WhrnQ80VW5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WhrnQ80VW5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WhrnQ80VW5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WhrnQ80VW5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WhrnQ80VW5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WhrnQ80VW5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WhrnQ80VW5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WhrnQ80VW5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WhrnQ80VW5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WhrnQ80VW5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WhrnQ80VW5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WhrnQ80VW5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WhrnQ80VW5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
WhrnQ80VW5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WhrnQ80VW5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
WhrnQ80VW5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WhrnQ80VW5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WhrnQ80VW5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WhrnQ80VW5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WhrnQ80VW5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WhrnQ80VW5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
WhrnQ80VW5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WhrnQ80VW5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WhrnQ80VW5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WhrnQ80VW5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WhrnQ80VW5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WhrnQ80VW5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WhrnQ80VW5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
WhrnQ80VW5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WhrnQ80VW5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
WhrnQ80VW5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WhrnQ80VW5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WhrnQ80VW5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
WhrnQ80VW5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
WhrnQ80VW5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WhrnQ80VW5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
WhrnQ80VW5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WhrnQ80VW5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WhrnQ80VW5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
WhrnQ80VW5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WhrnQ80VW5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WhrnQ80VW5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WhrnQ80VW5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WhrnQ80VW5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WhrnQ80VW5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WhrnQ80VW5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
WhrnQ80VW5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WhrnQ80VW5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WhrnQ80VW5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WhrnQ80VW5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
WhrnQ80VW5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
WhrnQ80VW5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WhrnQ80VW5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WhrnQ80VW5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WhrnQ80VW5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WhrnQ80VW5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WhrnQ80VW5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WhrnQ80VW5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WhrnQ80VW5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WhrnQ80VW5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WhrnQ80VW5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WhrnQ80VW5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WhrnQ80VW5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WhrnQ80VW5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WhrnQ80VW5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
WhrnQ80VW5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
WhrnQ80VW5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
WhrnQ80VW5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
WhrnQ80VW5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
WhrnQ80VW5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WhrnQ80VW5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WhrnQ80VW5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WhrnQ80VW5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WhrnQ80VW5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WhrnQ80VW5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WhrnQ80VW5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
WhrnQ80VW5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WhrnQ80VW5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WhrnQ80VW5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WhrnQ80VW5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WhrnQ80VW5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WhrnQ80VW5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WhrnQ80VW5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WhrnQ80VW5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WhrnQ80VW5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WhrnQ80VW5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WhrnQ80VW5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WhrnQ80VW5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms