Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lamp3Q7TST5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lamp3Q7TST5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lamp3Q7TST5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lamp3Q7TST5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lamp3Q7TST5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lamp3Q7TST5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lamp3Q7TST5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lamp3Q7TST5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lamp3Q7TST5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lamp3Q7TST5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lamp3Q7TST5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lamp3Q7TST5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lamp3Q7TST5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Lamp3Q7TST5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lamp3Q7TST5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lamp3Q7TST5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lamp3Q7TST5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lamp3Q7TST5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lamp3Q7TST5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Lamp3Q7TST5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lamp3Q7TST5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lamp3Q7TST5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lamp3Q7TST5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lamp3Q7TST5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lamp3Q7TST5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lamp3Q7TST5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lamp3Q7TST5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lamp3Q7TST5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lamp3Q7TST5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lamp3Q7TST5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lamp3Q7TST5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lamp3Q7TST5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lamp3Q7TST5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lamp3Q7TST5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lamp3Q7TST5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lamp3Q7TST5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lamp3Q7TST5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lamp3Q7TST5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lamp3Q7TST5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lamp3Q7TST5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lamp3Q7TST5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lamp3Q7TST5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lamp3Q7TST5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lamp3Q7TST5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lamp3Q7TST5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lamp3Q7TST5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lamp3Q7TST5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lamp3Q7TST5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lamp3Q7TST5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lamp3Q7TST5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lamp3Q7TST5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lamp3Q7TST5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lamp3Q7TST5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lamp3Q7TST5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lamp3Q7TST5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lamp3Q7TST5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lamp3Q7TST5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lamp3Q7TST5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lamp3Q7TST5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lamp3Q7TST5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lamp3Q7TST5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lamp3Q7TST5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lamp3Q7TST5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lamp3Q7TST5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lamp3Q7TST5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lamp3Q7TST5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Lamp3Q7TST5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lamp3Q7TST5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lamp3Q7TST5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lamp3Q7TST5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lamp3Q7TST5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Lamp3Q7TST5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Lamp3Q7TST5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lamp3Q7TST5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lamp3Q7TST5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lamp3Q7TST5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lamp3Q7TST5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lamp3Q7TST5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lamp3Q7TST5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lamp3Q7TST5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lamp3Q7TST5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lamp3Q7TST5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lamp3Q7TST5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lamp3Q7TST5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lamp3Q7TST5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lamp3Q7TST5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lamp3Q7TST5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lamp3Q7TST5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lamp3Q7TST5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lamp3Q7TST5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lamp3Q7TST5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lamp3Q7TST5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lamp3Q7TST5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Lamp3Q7TST5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Lamp3Q7TST5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lamp3Q7TST5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lamp3Q7TST5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lamp3Q7TST5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lamp3Q7TST5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms