Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdcl2Q78Y63 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdcl2Q78Y63 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdcl2Q78Y63 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdcl2Q78Y63 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdcl2Q78Y63 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdcl2Q78Y63 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdcl2Q78Y63 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdcl2Q78Y63 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdcl2Q78Y63 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdcl2Q78Y63 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdcl2Q78Y63 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdcl2Q78Y63 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdcl2Q78Y63 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdcl2Q78Y63 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdcl2Q78Y63 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdcl2Q78Y63 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdcl2Q78Y63 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdcl2Q78Y63 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdcl2Q78Y63 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdcl2Q78Y63 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Pdcl2Q78Y63 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pdcl2Q78Y63 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pdcl2Q78Y63 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pdcl2Q78Y63 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pdcl2Q78Y63 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Pdcl2Q78Y63 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pdcl2Q78Y63 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdcl2Q78Y63 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdcl2Q78Y63 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdcl2Q78Y63 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdcl2Q78Y63 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdcl2Q78Y63 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdcl2Q78Y63 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdcl2Q78Y63 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdcl2Q78Y63 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdcl2Q78Y63 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdcl2Q78Y63 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdcl2Q78Y63 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdcl2Q78Y63 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdcl2Q78Y63 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdcl2Q78Y63 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdcl2Q78Y63 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdcl2Q78Y63 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Pdcl2Q78Y63 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdcl2Q78Y63 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdcl2Q78Y63 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdcl2Q78Y63 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdcl2Q78Y63 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdcl2Q78Y63 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdcl2Q78Y63 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdcl2Q78Y63 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdcl2Q78Y63 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdcl2Q78Y63 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdcl2Q78Y63 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdcl2Q78Y63 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdcl2Q78Y63 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdcl2Q78Y63 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdcl2Q78Y63 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdcl2Q78Y63 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdcl2Q78Y63 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdcl2Q78Y63 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdcl2Q78Y63 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdcl2Q78Y63 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdcl2Q78Y63 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdcl2Q78Y63 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdcl2Q78Y63 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdcl2Q78Y63 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdcl2Q78Y63 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdcl2Q78Y63 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdcl2Q78Y63 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdcl2Q78Y63 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdcl2Q78Y63 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdcl2Q78Y63 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdcl2Q78Y63 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdcl2Q78Y63 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdcl2Q78Y63 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdcl2Q78Y63 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdcl2Q78Y63 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdcl2Q78Y63 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdcl2Q78Y63 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdcl2Q78Y63 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdcl2Q78Y63 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdcl2Q78Y63 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdcl2Q78Y63 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdcl2Q78Y63 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdcl2Q78Y63 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdcl2Q78Y63 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdcl2Q78Y63 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdcl2Q78Y63 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdcl2Q78Y63 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdcl2Q78Y63 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pdcl2Q78Y63 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pdcl2Q78Y63 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pdcl2Q78Y63 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pdcl2Q78Y63 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdcl2Q78Y63 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdcl2Q78Y63 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdcl2Q78Y63 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdcl2Q78Y63 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms