Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smim12Q78RX3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smim12Q78RX3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Smim12Q78RX3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smim12Q78RX3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smim12Q78RX3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smim12Q78RX3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smim12Q78RX3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smim12Q78RX3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smim12Q78RX3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Smim12Q78RX3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smim12Q78RX3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smim12Q78RX3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smim12Q78RX3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smim12Q78RX3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smim12Q78RX3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smim12Q78RX3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smim12Q78RX3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smim12Q78RX3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smim12Q78RX3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smim12Q78RX3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smim12Q78RX3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Smim12Q78RX3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Smim12Q78RX3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smim12Q78RX3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smim12Q78RX3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smim12Q78RX3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smim12Q78RX3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smim12Q78RX3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smim12Q78RX3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smim12Q78RX3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smim12Q78RX3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smim12Q78RX3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smim12Q78RX3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smim12Q78RX3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smim12Q78RX3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smim12Q78RX3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smim12Q78RX3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smim12Q78RX3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smim12Q78RX3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smim12Q78RX3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smim12Q78RX3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smim12Q78RX3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smim12Q78RX3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smim12Q78RX3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smim12Q78RX3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smim12Q78RX3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smim12Q78RX3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smim12Q78RX3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smim12Q78RX3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim12Q78RX3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim12Q78RX3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim12Q78RX3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim12Q78RX3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim12Q78RX3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim12Q78RX3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim12Q78RX3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim12Q78RX3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim12Q78RX3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim12Q78RX3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim12Q78RX3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smim12Q78RX3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smim12Q78RX3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smim12Q78RX3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smim12Q78RX3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smim12Q78RX3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smim12Q78RX3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smim12Q78RX3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smim12Q78RX3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim12Q78RX3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim12Q78RX3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim12Q78RX3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim12Q78RX3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim12Q78RX3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim12Q78RX3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim12Q78RX3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim12Q78RX3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smim12Q78RX3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smim12Q78RX3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smim12Q78RX3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smim12Q78RX3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smim12Q78RX3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smim12Q78RX3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smim12Q78RX3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Smim12Q78RX3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Smim12Q78RX3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Smim12Q78RX3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Smim12Q78RX3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smim12Q78RX3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smim12Q78RX3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smim12Q78RX3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smim12Q78RX3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smim12Q78RX3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smim12Q78RX3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim12Q78RX3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim12Q78RX3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim12Q78RX3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim12Q78RX3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim12Q78RX3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim12Q78RX3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms