Protein–RNA interactions for Protein: Q70E20

Sned1, Sushi, nidogen and EGF-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sned1Q70E20 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Sned1Q70E20 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sned1Q70E20 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sned1Q70E20 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sned1Q70E20 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sned1Q70E20 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Sned1Q70E20 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sned1Q70E20 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sned1Q70E20 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sned1Q70E20 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Sned1Q70E20 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sned1Q70E20 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Sned1Q70E20 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sned1Q70E20 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sned1Q70E20 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sned1Q70E20 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sned1Q70E20 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sned1Q70E20 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sned1Q70E20 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sned1Q70E20 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sned1Q70E20 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Sned1Q70E20 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sned1Q70E20 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sned1Q70E20 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sned1Q70E20 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sned1Q70E20 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sned1Q70E20 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sned1Q70E20 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sned1Q70E20 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sned1Q70E20 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sned1Q70E20 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sned1Q70E20 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sned1Q70E20 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sned1Q70E20 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sned1Q70E20 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sned1Q70E20 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sned1Q70E20 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sned1Q70E20 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sned1Q70E20 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sned1Q70E20 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sned1Q70E20 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sned1Q70E20 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sned1Q70E20 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sned1Q70E20 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sned1Q70E20 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sned1Q70E20 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Sned1Q70E20 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sned1Q70E20 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sned1Q70E20 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sned1Q70E20 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sned1Q70E20 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sned1Q70E20 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sned1Q70E20 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sned1Q70E20 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sned1Q70E20 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sned1Q70E20 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sned1Q70E20 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sned1Q70E20 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sned1Q70E20 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sned1Q70E20 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sned1Q70E20 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sned1Q70E20 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sned1Q70E20 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sned1Q70E20 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sned1Q70E20 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sned1Q70E20 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sned1Q70E20 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sned1Q70E20 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sned1Q70E20 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sned1Q70E20 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sned1Q70E20 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sned1Q70E20 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sned1Q70E20 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sned1Q70E20 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sned1Q70E20 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sned1Q70E20 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sned1Q70E20 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sned1Q70E20 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sned1Q70E20 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sned1Q70E20 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sned1Q70E20 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sned1Q70E20 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Sned1Q70E20 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sned1Q70E20 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sned1Q70E20 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Sned1Q70E20 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Sned1Q70E20 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sned1Q70E20 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sned1Q70E20 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sned1Q70E20 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sned1Q70E20 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sned1Q70E20 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sned1Q70E20 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sned1Q70E20 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sned1Q70E20 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sned1Q70E20 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sned1Q70E20 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sned1Q70E20 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sned1Q70E20 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Sned1Q70E20 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms