Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Syne2Q6ZWQ0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms