Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SvoplQ6PDF3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SvoplQ6PDF3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SvoplQ6PDF3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SvoplQ6PDF3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
SvoplQ6PDF3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SvoplQ6PDF3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SvoplQ6PDF3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SvoplQ6PDF3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SvoplQ6PDF3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SvoplQ6PDF3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SvoplQ6PDF3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SvoplQ6PDF3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SvoplQ6PDF3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SvoplQ6PDF3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SvoplQ6PDF3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SvoplQ6PDF3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SvoplQ6PDF3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SvoplQ6PDF3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SvoplQ6PDF3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SvoplQ6PDF3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SvoplQ6PDF3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SvoplQ6PDF3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SvoplQ6PDF3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SvoplQ6PDF3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SvoplQ6PDF3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SvoplQ6PDF3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SvoplQ6PDF3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SvoplQ6PDF3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SvoplQ6PDF3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SvoplQ6PDF3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SvoplQ6PDF3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SvoplQ6PDF3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SvoplQ6PDF3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SvoplQ6PDF3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SvoplQ6PDF3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SvoplQ6PDF3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SvoplQ6PDF3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SvoplQ6PDF3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SvoplQ6PDF3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SvoplQ6PDF3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SvoplQ6PDF3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SvoplQ6PDF3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SvoplQ6PDF3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SvoplQ6PDF3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SvoplQ6PDF3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SvoplQ6PDF3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SvoplQ6PDF3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SvoplQ6PDF3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SvoplQ6PDF3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SvoplQ6PDF3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SvoplQ6PDF3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SvoplQ6PDF3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SvoplQ6PDF3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SvoplQ6PDF3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SvoplQ6PDF3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SvoplQ6PDF3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SvoplQ6PDF3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SvoplQ6PDF3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SvoplQ6PDF3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SvoplQ6PDF3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SvoplQ6PDF3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SvoplQ6PDF3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SvoplQ6PDF3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SvoplQ6PDF3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SvoplQ6PDF3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SvoplQ6PDF3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SvoplQ6PDF3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SvoplQ6PDF3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SvoplQ6PDF3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SvoplQ6PDF3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SvoplQ6PDF3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SvoplQ6PDF3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SvoplQ6PDF3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SvoplQ6PDF3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SvoplQ6PDF3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SvoplQ6PDF3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SvoplQ6PDF3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SvoplQ6PDF3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SvoplQ6PDF3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SvoplQ6PDF3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SvoplQ6PDF3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SvoplQ6PDF3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SvoplQ6PDF3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SvoplQ6PDF3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SvoplQ6PDF3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SvoplQ6PDF3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SvoplQ6PDF3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SvoplQ6PDF3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SvoplQ6PDF3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SvoplQ6PDF3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SvoplQ6PDF3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SvoplQ6PDF3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SvoplQ6PDF3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SvoplQ6PDF3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SvoplQ6PDF3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SvoplQ6PDF3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SvoplQ6PDF3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SvoplQ6PDF3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SvoplQ6PDF3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms