Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS60

Fbxo41, F-box only protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo41Q6NS60 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Fbxo41Q6NS60 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Fbxo41Q6NS60 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Fbxo41Q6NS60 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Fbxo41Q6NS60 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Fbxo41Q6NS60 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Fbxo41Q6NS60 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Fbxo41Q6NS60 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Fbxo41Q6NS60 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Fbxo41Q6NS60 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Fbxo41Q6NS60 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Fbxo41Q6NS60 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Fbxo41Q6NS60 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Fbxo41Q6NS60 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Fbxo41Q6NS60 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Fbxo41Q6NS60 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Fbxo41Q6NS60 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Fbxo41Q6NS60 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Fbxo41Q6NS60 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Fbxo41Q6NS60 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Fbxo41Q6NS60 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Fbxo41Q6NS60 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Fbxo41Q6NS60 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Fbxo41Q6NS60 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Fbxo41Q6NS60 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Fbxo41Q6NS60 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Fbxo41Q6NS60 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Fbxo41Q6NS60 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Fbxo41Q6NS60 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Fbxo41Q6NS60 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Fbxo41Q6NS60 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Fbxo41Q6NS60 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Fbxo41Q6NS60 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Fbxo41Q6NS60 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Fbxo41Q6NS60 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Fbxo41Q6NS60 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Fbxo41Q6NS60 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Fbxo41Q6NS60 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Fbxo41Q6NS60 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Fbxo41Q6NS60 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Fbxo41Q6NS60 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Fbxo41Q6NS60 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Fbxo41Q6NS60 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Fbxo41Q6NS60 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Fbxo41Q6NS60 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Fbxo41Q6NS60 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Fbxo41Q6NS60 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Fbxo41Q6NS60 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Fbxo41Q6NS60 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Fbxo41Q6NS60 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Fbxo41Q6NS60 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Fbxo41Q6NS60 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Fbxo41Q6NS60 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Fbxo41Q6NS60 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Fbxo41Q6NS60 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Fbxo41Q6NS60 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Fbxo41Q6NS60 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Fbxo41Q6NS60 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Fbxo41Q6NS60 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Fbxo41Q6NS60 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Fbxo41Q6NS60 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Fbxo41Q6NS60 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Fbxo41Q6NS60 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Fbxo41Q6NS60 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Fbxo41Q6NS60 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Fbxo41Q6NS60 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Fbxo41Q6NS60 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Fbxo41Q6NS60 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Fbxo41Q6NS60 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Fbxo41Q6NS60 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Fbxo41Q6NS60 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Fbxo41Q6NS60 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Fbxo41Q6NS60 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Fbxo41Q6NS60 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Fbxo41Q6NS60 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Fbxo41Q6NS60 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Fbxo41Q6NS60 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Fbxo41Q6NS60 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Fbxo41Q6NS60 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Fbxo41Q6NS60 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Fbxo41Q6NS60 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Fbxo41Q6NS60 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Fbxo41Q6NS60 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Fbxo41Q6NS60 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Fbxo41Q6NS60 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Fbxo41Q6NS60 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Fbxo41Q6NS60 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Fbxo41Q6NS60 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Fbxo41Q6NS60 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Fbxo41Q6NS60 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Fbxo41Q6NS60 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Fbxo41Q6NS60 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Fbxo41Q6NS60 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Fbxo41Q6NS60 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Fbxo41Q6NS60 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Fbxo41Q6NS60 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Fbxo41Q6NS60 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Fbxo41Q6NS60 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Fbxo41Q6NS60 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Fbxo41Q6NS60 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms