Protein–RNA interactions for Protein: Q62395

Tff3, Trefoil factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff3Q62395 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tff3Q62395 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tff3Q62395 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tff3Q62395 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tff3Q62395 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tff3Q62395 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tff3Q62395 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tff3Q62395 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tff3Q62395 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tff3Q62395 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tff3Q62395 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tff3Q62395 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tff3Q62395 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tff3Q62395 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tff3Q62395 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tff3Q62395 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tff3Q62395 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tff3Q62395 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tff3Q62395 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tff3Q62395 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tff3Q62395 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tff3Q62395 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tff3Q62395 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tff3Q62395 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tff3Q62395 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tff3Q62395 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tff3Q62395 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tff3Q62395 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tff3Q62395 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tff3Q62395 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tff3Q62395 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tff3Q62395 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tff3Q62395 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tff3Q62395 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tff3Q62395 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tff3Q62395 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tff3Q62395 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tff3Q62395 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tff3Q62395 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tff3Q62395 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tff3Q62395 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tff3Q62395 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tff3Q62395 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tff3Q62395 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tff3Q62395 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tff3Q62395 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tff3Q62395 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tff3Q62395 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tff3Q62395 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tff3Q62395 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tff3Q62395 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tff3Q62395 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tff3Q62395 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tff3Q62395 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tff3Q62395 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tff3Q62395 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tff3Q62395 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tff3Q62395 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tff3Q62395 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tff3Q62395 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tff3Q62395 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tff3Q62395 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tff3Q62395 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tff3Q62395 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tff3Q62395 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tff3Q62395 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tff3Q62395 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tff3Q62395 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tff3Q62395 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tff3Q62395 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tff3Q62395 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tff3Q62395 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tff3Q62395 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tff3Q62395 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tff3Q62395 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tff3Q62395 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tff3Q62395 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tff3Q62395 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tff3Q62395 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tff3Q62395 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tff3Q62395 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tff3Q62395 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tff3Q62395 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tff3Q62395 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tff3Q62395 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tff3Q62395 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tff3Q62395 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tff3Q62395 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tff3Q62395 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tff3Q62395 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tff3Q62395 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tff3Q62395 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tff3Q62395 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tff3Q62395 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tff3Q62395 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tff3Q62395 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tff3Q62395 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tff3Q62395 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tff3Q62395 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tff3Q62395 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms