Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ss18Q62280 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ss18Q62280 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ss18Q62280 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ss18Q62280 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ss18Q62280 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ss18Q62280 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ss18Q62280 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ss18Q62280 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ss18Q62280 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ss18Q62280 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ss18Q62280 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ss18Q62280 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ss18Q62280 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ss18Q62280 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ss18Q62280 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ss18Q62280 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ss18Q62280 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ss18Q62280 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ss18Q62280 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ss18Q62280 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ss18Q62280 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ss18Q62280 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ss18Q62280 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ss18Q62280 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ss18Q62280 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ss18Q62280 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ss18Q62280 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ss18Q62280 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ss18Q62280 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ss18Q62280 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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Ss18Q62280 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ss18Q62280 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ss18Q62280 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ss18Q62280 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ss18Q62280 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ss18Q62280 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ss18Q62280 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ss18Q62280 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ss18Q62280 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ss18Q62280 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ss18Q62280 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ss18Q62280 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ss18Q62280 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ss18Q62280 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ss18Q62280 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ss18Q62280 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ss18Q62280 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ss18Q62280 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ss18Q62280 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ss18Q62280 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ss18Q62280 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ss18Q62280 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ss18Q62280 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ss18Q62280 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ss18Q62280 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ss18Q62280 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ss18Q62280 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ss18Q62280 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Ss18Q62280 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Ss18Q62280 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ss18Q62280 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ss18Q62280 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ss18Q62280 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ss18Q62280 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ss18Q62280 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ss18Q62280 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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Ss18Q62280 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ss18Q62280 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ss18Q62280 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ss18Q62280 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ss18Q62280 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ss18Q62280 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ss18Q62280 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ss18Q62280 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ss18Q62280 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ss18Q62280 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ss18Q62280 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ss18Q62280 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ss18Q62280 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ss18Q62280 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ss18Q62280 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ss18Q62280 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ss18Q62280 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ss18Q62280 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ss18Q62280 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ss18Q62280 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ss18Q62280 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ss18Q62280 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ss18Q62280 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ss18Q62280 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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