Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rbbp4Q60972 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rbbp4Q60972 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rbbp4Q60972 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rbbp4Q60972 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rbbp4Q60972 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rbbp4Q60972 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rbbp4Q60972 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rbbp4Q60972 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rbbp4Q60972 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rbbp4Q60972 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rbbp4Q60972 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rbbp4Q60972 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rbbp4Q60972 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rbbp4Q60972 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rbbp4Q60972 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rbbp4Q60972 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Rbbp4Q60972 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rbbp4Q60972 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rbbp4Q60972 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rbbp4Q60972 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rbbp4Q60972 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rbbp4Q60972 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rbbp4Q60972 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rbbp4Q60972 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rbbp4Q60972 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rbbp4Q60972 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rbbp4Q60972 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rbbp4Q60972 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rbbp4Q60972 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rbbp4Q60972 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rbbp4Q60972 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rbbp4Q60972 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rbbp4Q60972 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rbbp4Q60972 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rbbp4Q60972 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rbbp4Q60972 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rbbp4Q60972 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rbbp4Q60972 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rbbp4Q60972 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rbbp4Q60972 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rbbp4Q60972 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rbbp4Q60972 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rbbp4Q60972 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rbbp4Q60972 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rbbp4Q60972 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rbbp4Q60972 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rbbp4Q60972 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rbbp4Q60972 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rbbp4Q60972 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rbbp4Q60972 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rbbp4Q60972 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rbbp4Q60972 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rbbp4Q60972 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rbbp4Q60972 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rbbp4Q60972 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rbbp4Q60972 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rbbp4Q60972 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rbbp4Q60972 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Rbbp4Q60972 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rbbp4Q60972 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rbbp4Q60972 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rbbp4Q60972 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rbbp4Q60972 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rbbp4Q60972 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rbbp4Q60972 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rbbp4Q60972 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rbbp4Q60972 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rbbp4Q60972 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rbbp4Q60972 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rbbp4Q60972 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Rbbp4Q60972 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rbbp4Q60972 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rbbp4Q60972 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rbbp4Q60972 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rbbp4Q60972 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rbbp4Q60972 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rbbp4Q60972 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rbbp4Q60972 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rbbp4Q60972 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rbbp4Q60972 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rbbp4Q60972 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rbbp4Q60972 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Rbbp4Q60972 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Rbbp4Q60972 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rbbp4Q60972 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Rbbp4Q60972 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rbbp4Q60972 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rbbp4Q60972 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rbbp4Q60972 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Rbbp4Q60972 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Rbbp4Q60972 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rbbp4Q60972 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Rbbp4Q60972 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rbbp4Q60972 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rbbp4Q60972 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rbbp4Q60972 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rbbp4Q60972 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Rbbp4Q60972 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rbbp4Q60972 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms