Protein–RNA interactions for Protein: Q60720

Cyb561, Cytochrome b561, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyb561Q60720 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyb561Q60720 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyb561Q60720 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyb561Q60720 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyb561Q60720 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyb561Q60720 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyb561Q60720 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyb561Q60720 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyb561Q60720 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyb561Q60720 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyb561Q60720 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyb561Q60720 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyb561Q60720 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyb561Q60720 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyb561Q60720 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyb561Q60720 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyb561Q60720 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyb561Q60720 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyb561Q60720 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyb561Q60720 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyb561Q60720 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyb561Q60720 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyb561Q60720 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyb561Q60720 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyb561Q60720 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cyb561Q60720 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cyb561Q60720 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cyb561Q60720 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyb561Q60720 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyb561Q60720 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyb561Q60720 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyb561Q60720 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyb561Q60720 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyb561Q60720 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyb561Q60720 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyb561Q60720 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyb561Q60720 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyb561Q60720 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyb561Q60720 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyb561Q60720 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyb561Q60720 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyb561Q60720 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyb561Q60720 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyb561Q60720 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyb561Q60720 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyb561Q60720 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyb561Q60720 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyb561Q60720 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyb561Q60720 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyb561Q60720 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyb561Q60720 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyb561Q60720 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyb561Q60720 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyb561Q60720 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyb561Q60720 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyb561Q60720 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyb561Q60720 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyb561Q60720 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyb561Q60720 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyb561Q60720 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyb561Q60720 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyb561Q60720 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyb561Q60720 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyb561Q60720 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyb561Q60720 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyb561Q60720 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyb561Q60720 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyb561Q60720 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyb561Q60720 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyb561Q60720 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyb561Q60720 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyb561Q60720 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyb561Q60720 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyb561Q60720 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyb561Q60720 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyb561Q60720 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyb561Q60720 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyb561Q60720 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyb561Q60720 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyb561Q60720 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyb561Q60720 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyb561Q60720 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyb561Q60720 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyb561Q60720 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyb561Q60720 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyb561Q60720 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyb561Q60720 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyb561Q60720 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyb561Q60720 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyb561Q60720 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyb561Q60720 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyb561Q60720 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyb561Q60720 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyb561Q60720 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyb561Q60720 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyb561Q60720 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyb561Q60720 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyb561Q60720 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyb561Q60720 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyb561Q60720 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms