Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ecm2Q5FW85 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ecm2Q5FW85 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ecm2Q5FW85 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ecm2Q5FW85 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ecm2Q5FW85 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ecm2Q5FW85 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ecm2Q5FW85 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ecm2Q5FW85 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Ecm2Q5FW85 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Ecm2Q5FW85 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ecm2Q5FW85 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ecm2Q5FW85 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ecm2Q5FW85 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ecm2Q5FW85 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ecm2Q5FW85 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ecm2Q5FW85 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ecm2Q5FW85 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Ecm2Q5FW85 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ecm2Q5FW85 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ecm2Q5FW85 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ecm2Q5FW85 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Ecm2Q5FW85 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Ecm2Q5FW85 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ecm2Q5FW85 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ecm2Q5FW85 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ecm2Q5FW85 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ecm2Q5FW85 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ecm2Q5FW85 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ecm2Q5FW85 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ecm2Q5FW85 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ecm2Q5FW85 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ecm2Q5FW85 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ecm2Q5FW85 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ecm2Q5FW85 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ecm2Q5FW85 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ecm2Q5FW85 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ecm2Q5FW85 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Ecm2Q5FW85 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Ecm2Q5FW85 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ecm2Q5FW85 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ecm2Q5FW85 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Ecm2Q5FW85 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ecm2Q5FW85 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ecm2Q5FW85 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ecm2Q5FW85 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ecm2Q5FW85 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ecm2Q5FW85 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ecm2Q5FW85 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ecm2Q5FW85 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ecm2Q5FW85 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ecm2Q5FW85 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ecm2Q5FW85 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ecm2Q5FW85 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Ecm2Q5FW85 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ecm2Q5FW85 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ecm2Q5FW85 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ecm2Q5FW85 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ecm2Q5FW85 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ecm2Q5FW85 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ecm2Q5FW85 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ecm2Q5FW85 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Ecm2Q5FW85 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ecm2Q5FW85 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ecm2Q5FW85 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ecm2Q5FW85 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ecm2Q5FW85 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ecm2Q5FW85 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ecm2Q5FW85 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ecm2Q5FW85 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ecm2Q5FW85 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ecm2Q5FW85 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ecm2Q5FW85 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ecm2Q5FW85 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ecm2Q5FW85 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ecm2Q5FW85 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ecm2Q5FW85 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ecm2Q5FW85 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ecm2Q5FW85 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ecm2Q5FW85 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ecm2Q5FW85 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ecm2Q5FW85 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ecm2Q5FW85 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ecm2Q5FW85 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ecm2Q5FW85 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ecm2Q5FW85 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ecm2Q5FW85 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ecm2Q5FW85 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Ecm2Q5FW85 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ecm2Q5FW85 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ecm2Q5FW85 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ecm2Q5FW85 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ecm2Q5FW85 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ecm2Q5FW85 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ecm2Q5FW85 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ecm2Q5FW85 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ecm2Q5FW85 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ecm2Q5FW85 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ecm2Q5FW85 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ecm2Q5FW85 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms