Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trafd1Q3UDK1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trafd1Q3UDK1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trafd1Q3UDK1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trafd1Q3UDK1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trafd1Q3UDK1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trafd1Q3UDK1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trafd1Q3UDK1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trafd1Q3UDK1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trafd1Q3UDK1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trafd1Q3UDK1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trafd1Q3UDK1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trafd1Q3UDK1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trafd1Q3UDK1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trafd1Q3UDK1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trafd1Q3UDK1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trafd1Q3UDK1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trafd1Q3UDK1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trafd1Q3UDK1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Trafd1Q3UDK1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trafd1Q3UDK1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trafd1Q3UDK1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trafd1Q3UDK1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trafd1Q3UDK1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trafd1Q3UDK1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trafd1Q3UDK1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trafd1Q3UDK1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trafd1Q3UDK1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trafd1Q3UDK1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trafd1Q3UDK1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trafd1Q3UDK1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trafd1Q3UDK1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trafd1Q3UDK1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trafd1Q3UDK1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trafd1Q3UDK1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trafd1Q3UDK1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trafd1Q3UDK1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trafd1Q3UDK1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trafd1Q3UDK1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trafd1Q3UDK1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trafd1Q3UDK1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trafd1Q3UDK1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trafd1Q3UDK1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trafd1Q3UDK1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trafd1Q3UDK1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trafd1Q3UDK1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trafd1Q3UDK1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trafd1Q3UDK1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trafd1Q3UDK1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Trafd1Q3UDK1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trafd1Q3UDK1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trafd1Q3UDK1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trafd1Q3UDK1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trafd1Q3UDK1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trafd1Q3UDK1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trafd1Q3UDK1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trafd1Q3UDK1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trafd1Q3UDK1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trafd1Q3UDK1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trafd1Q3UDK1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trafd1Q3UDK1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trafd1Q3UDK1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trafd1Q3UDK1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trafd1Q3UDK1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trafd1Q3UDK1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trafd1Q3UDK1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trafd1Q3UDK1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trafd1Q3UDK1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trafd1Q3UDK1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trafd1Q3UDK1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trafd1Q3UDK1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trafd1Q3UDK1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trafd1Q3UDK1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trafd1Q3UDK1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trafd1Q3UDK1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trafd1Q3UDK1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Trafd1Q3UDK1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trafd1Q3UDK1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Trafd1Q3UDK1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Trafd1Q3UDK1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trafd1Q3UDK1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trafd1Q3UDK1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trafd1Q3UDK1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trafd1Q3UDK1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trafd1Q3UDK1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trafd1Q3UDK1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trafd1Q3UDK1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trafd1Q3UDK1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trafd1Q3UDK1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trafd1Q3UDK1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trafd1Q3UDK1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trafd1Q3UDK1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trafd1Q3UDK1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trafd1Q3UDK1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trafd1Q3UDK1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trafd1Q3UDK1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trafd1Q3UDK1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trafd1Q3UDK1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trafd1Q3UDK1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trafd1Q3UDK1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms