Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gtpbp6Q3U6U5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gtpbp6Q3U6U5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gtpbp6Q3U6U5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Gtpbp6Q3U6U5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gtpbp6Q3U6U5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gtpbp6Q3U6U5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Gtpbp6Q3U6U5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gtpbp6Q3U6U5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gtpbp6Q3U6U5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gtpbp6Q3U6U5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Gtpbp6Q3U6U5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gtpbp6Q3U6U5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gtpbp6Q3U6U5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gtpbp6Q3U6U5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gtpbp6Q3U6U5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gtpbp6Q3U6U5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Gtpbp6Q3U6U5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Gtpbp6Q3U6U5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gtpbp6Q3U6U5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gtpbp6Q3U6U5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gtpbp6Q3U6U5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gtpbp6Q3U6U5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gtpbp6Q3U6U5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gtpbp6Q3U6U5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gtpbp6Q3U6U5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gtpbp6Q3U6U5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gtpbp6Q3U6U5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gtpbp6Q3U6U5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gtpbp6Q3U6U5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gtpbp6Q3U6U5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gtpbp6Q3U6U5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Gtpbp6Q3U6U5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gtpbp6Q3U6U5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gtpbp6Q3U6U5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gtpbp6Q3U6U5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gtpbp6Q3U6U5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gtpbp6Q3U6U5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gtpbp6Q3U6U5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gtpbp6Q3U6U5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gtpbp6Q3U6U5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gtpbp6Q3U6U5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gtpbp6Q3U6U5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gtpbp6Q3U6U5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Gtpbp6Q3U6U5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gtpbp6Q3U6U5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gtpbp6Q3U6U5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gtpbp6Q3U6U5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gtpbp6Q3U6U5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gtpbp6Q3U6U5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gtpbp6Q3U6U5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gtpbp6Q3U6U5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gtpbp6Q3U6U5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gtpbp6Q3U6U5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gtpbp6Q3U6U5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gtpbp6Q3U6U5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gtpbp6Q3U6U5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gtpbp6Q3U6U5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gtpbp6Q3U6U5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gtpbp6Q3U6U5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gtpbp6Q3U6U5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gtpbp6Q3U6U5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gtpbp6Q3U6U5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gtpbp6Q3U6U5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gtpbp6Q3U6U5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gtpbp6Q3U6U5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gtpbp6Q3U6U5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gtpbp6Q3U6U5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Gtpbp6Q3U6U5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms