Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3U1D9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3U1D9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3U1D9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3U1D9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3U1D9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3U1D9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3U1D9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3U1D9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3U1D9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3U1D9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3U1D9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3U1D9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3U1D9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3U1D9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3U1D9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3U1D9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3U1D9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3U1D9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3U1D9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3U1D9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3U1D9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3U1D9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3U1D9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3U1D9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3U1D9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3U1D9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3U1D9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3U1D9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3U1D9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3U1D9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3U1D9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3U1D9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3U1D9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3U1D9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3U1D9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3U1D9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q3U1D9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q3U1D9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q3U1D9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3U1D9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3U1D9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3U1D9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3U1D9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3U1D9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3U1D9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3U1D9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3U1D9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3U1D9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3U1D9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3U1D9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Q3U1D9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q3U1D9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3U1D9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3U1D9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3U1D9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3U1D9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Q3U1D9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3U1D9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3U1D9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3U1D9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3U1D9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3U1D9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3U1D9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3U1D9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3U1D9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3U1D9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3U1D9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3U1D9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3U1D9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3U1D9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3U1D9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3U1D9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3U1D9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3U1D9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3U1D9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3U1D9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3U1D9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3U1D9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3U1D9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3U1D9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3U1D9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3U1D9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3U1D9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3U1D9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3U1D9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3U1D9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3U1D9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3U1D9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3U1D9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3U1D9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3U1D9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3U1D9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q3U1D9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3U1D9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3U1D9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3U1D9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3U1D9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q3U1D9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q3U1D9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms