Protein–RNA interactions for Protein: Q3THW5

H2afv, Histone H2A.V, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afvQ3THW5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
H2afvQ3THW5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
H2afvQ3THW5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
H2afvQ3THW5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
H2afvQ3THW5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2afvQ3THW5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2afvQ3THW5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2afvQ3THW5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2afvQ3THW5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2afvQ3THW5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2afvQ3THW5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2afvQ3THW5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2afvQ3THW5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2afvQ3THW5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2afvQ3THW5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2afvQ3THW5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2afvQ3THW5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2afvQ3THW5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2afvQ3THW5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2afvQ3THW5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2afvQ3THW5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2afvQ3THW5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2afvQ3THW5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2afvQ3THW5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2afvQ3THW5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2afvQ3THW5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2afvQ3THW5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2afvQ3THW5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2afvQ3THW5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2afvQ3THW5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2afvQ3THW5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2afvQ3THW5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2afvQ3THW5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2afvQ3THW5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2afvQ3THW5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2afvQ3THW5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2afvQ3THW5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2afvQ3THW5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2afvQ3THW5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2afvQ3THW5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2afvQ3THW5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2afvQ3THW5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2afvQ3THW5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2afvQ3THW5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2afvQ3THW5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2afvQ3THW5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2afvQ3THW5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2afvQ3THW5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2afvQ3THW5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2afvQ3THW5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2afvQ3THW5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2afvQ3THW5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2afvQ3THW5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
H2afvQ3THW5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2afvQ3THW5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
H2afvQ3THW5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2afvQ3THW5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2afvQ3THW5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2afvQ3THW5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2afvQ3THW5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2afvQ3THW5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2afvQ3THW5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
H2afvQ3THW5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
H2afvQ3THW5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
H2afvQ3THW5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2afvQ3THW5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2afvQ3THW5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2afvQ3THW5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2afvQ3THW5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2afvQ3THW5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2afvQ3THW5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2afvQ3THW5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2afvQ3THW5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2afvQ3THW5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2afvQ3THW5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2afvQ3THW5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2afvQ3THW5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2afvQ3THW5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2afvQ3THW5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2afvQ3THW5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2afvQ3THW5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2afvQ3THW5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2afvQ3THW5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2afvQ3THW5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2afvQ3THW5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2afvQ3THW5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2afvQ3THW5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2afvQ3THW5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2afvQ3THW5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2afvQ3THW5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2afvQ3THW5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2afvQ3THW5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2afvQ3THW5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
H2afvQ3THW5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2afvQ3THW5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2afvQ3THW5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2afvQ3THW5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2afvQ3THW5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2afvQ3THW5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2afvQ3THW5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159.8 ms