Protein–RNA interactions for Protein: Q3LR78

Zbtb38, CtBP-interacting BTB zinc finger protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb38Q3LR78 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Zbtb38Q3LR78 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Zbtb38Q3LR78 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Zbtb38Q3LR78 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Zbtb38Q3LR78 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Zbtb38Q3LR78 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Zbtb38Q3LR78 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Zbtb38Q3LR78 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Zbtb38Q3LR78 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Zbtb38Q3LR78 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Zbtb38Q3LR78 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Zbtb38Q3LR78 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Zbtb38Q3LR78 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Zbtb38Q3LR78 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Zbtb38Q3LR78 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Zbtb38Q3LR78 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Zbtb38Q3LR78 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Zbtb38Q3LR78 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Zbtb38Q3LR78 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Zbtb38Q3LR78 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Zbtb38Q3LR78 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Zbtb38Q3LR78 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Zbtb38Q3LR78 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Zbtb38Q3LR78 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Zbtb38Q3LR78 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Zbtb38Q3LR78 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Zbtb38Q3LR78 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Zbtb38Q3LR78 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Zbtb38Q3LR78 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Zbtb38Q3LR78 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Zbtb38Q3LR78 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Zbtb38Q3LR78 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Zbtb38Q3LR78 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Zbtb38Q3LR78 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Zbtb38Q3LR78 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Zbtb38Q3LR78 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Zbtb38Q3LR78 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Zbtb38Q3LR78 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Zbtb38Q3LR78 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Zbtb38Q3LR78 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Zbtb38Q3LR78 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Zbtb38Q3LR78 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Zbtb38Q3LR78 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Zbtb38Q3LR78 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.68
Zbtb38Q3LR78 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zbtb38Q3LR78 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zbtb38Q3LR78 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zbtb38Q3LR78 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zbtb38Q3LR78 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Zbtb38Q3LR78 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zbtb38Q3LR78 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zbtb38Q3LR78 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zbtb38Q3LR78 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zbtb38Q3LR78 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zbtb38Q3LR78 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zbtb38Q3LR78 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zbtb38Q3LR78 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zbtb38Q3LR78 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Zbtb38Q3LR78 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Zbtb38Q3LR78 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zbtb38Q3LR78 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zbtb38Q3LR78 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zbtb38Q3LR78 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zbtb38Q3LR78 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Zbtb38Q3LR78 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zbtb38Q3LR78 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zbtb38Q3LR78 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zbtb38Q3LR78 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zbtb38Q3LR78 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zbtb38Q3LR78 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zbtb38Q3LR78 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zbtb38Q3LR78 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zbtb38Q3LR78 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zbtb38Q3LR78 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zbtb38Q3LR78 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zbtb38Q3LR78 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zbtb38Q3LR78 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zbtb38Q3LR78 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zbtb38Q3LR78 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zbtb38Q3LR78 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Zbtb38Q3LR78 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zbtb38Q3LR78 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zbtb38Q3LR78 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Zbtb38Q3LR78 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zbtb38Q3LR78 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zbtb38Q3LR78 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zbtb38Q3LR78 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zbtb38Q3LR78 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zbtb38Q3LR78 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Zbtb38Q3LR78 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zbtb38Q3LR78 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zbtb38Q3LR78 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zbtb38Q3LR78 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zbtb38Q3LR78 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zbtb38Q3LR78 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zbtb38Q3LR78 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zbtb38Q3LR78 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zbtb38Q3LR78 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zbtb38Q3LR78 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zbtb38Q3LR78 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms