Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdgfl1Q2VPR5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdgfl1Q2VPR5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdgfl1Q2VPR5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdgfl1Q2VPR5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdgfl1Q2VPR5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdgfl1Q2VPR5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdgfl1Q2VPR5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdgfl1Q2VPR5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdgfl1Q2VPR5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdgfl1Q2VPR5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdgfl1Q2VPR5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdgfl1Q2VPR5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdgfl1Q2VPR5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdgfl1Q2VPR5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdgfl1Q2VPR5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdgfl1Q2VPR5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdgfl1Q2VPR5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdgfl1Q2VPR5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdgfl1Q2VPR5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdgfl1Q2VPR5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdgfl1Q2VPR5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdgfl1Q2VPR5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdgfl1Q2VPR5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdgfl1Q2VPR5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdgfl1Q2VPR5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdgfl1Q2VPR5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdgfl1Q2VPR5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdgfl1Q2VPR5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdgfl1Q2VPR5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdgfl1Q2VPR5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdgfl1Q2VPR5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdgfl1Q2VPR5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdgfl1Q2VPR5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdgfl1Q2VPR5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdgfl1Q2VPR5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdgfl1Q2VPR5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdgfl1Q2VPR5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdgfl1Q2VPR5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdgfl1Q2VPR5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdgfl1Q2VPR5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdgfl1Q2VPR5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdgfl1Q2VPR5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdgfl1Q2VPR5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdgfl1Q2VPR5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdgfl1Q2VPR5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdgfl1Q2VPR5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdgfl1Q2VPR5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdgfl1Q2VPR5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdgfl1Q2VPR5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdgfl1Q2VPR5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdgfl1Q2VPR5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdgfl1Q2VPR5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdgfl1Q2VPR5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdgfl1Q2VPR5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdgfl1Q2VPR5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdgfl1Q2VPR5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdgfl1Q2VPR5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdgfl1Q2VPR5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdgfl1Q2VPR5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdgfl1Q2VPR5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdgfl1Q2VPR5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdgfl1Q2VPR5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdgfl1Q2VPR5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdgfl1Q2VPR5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdgfl1Q2VPR5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdgfl1Q2VPR5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdgfl1Q2VPR5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdgfl1Q2VPR5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdgfl1Q2VPR5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdgfl1Q2VPR5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdgfl1Q2VPR5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdgfl1Q2VPR5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdgfl1Q2VPR5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdgfl1Q2VPR5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdgfl1Q2VPR5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdgfl1Q2VPR5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdgfl1Q2VPR5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdgfl1Q2VPR5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdgfl1Q2VPR5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdgfl1Q2VPR5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdgfl1Q2VPR5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdgfl1Q2VPR5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdgfl1Q2VPR5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdgfl1Q2VPR5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdgfl1Q2VPR5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdgfl1Q2VPR5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdgfl1Q2VPR5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdgfl1Q2VPR5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdgfl1Q2VPR5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdgfl1Q2VPR5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdgfl1Q2VPR5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdgfl1Q2VPR5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdgfl1Q2VPR5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdgfl1Q2VPR5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Hdgfl1Q2VPR5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdgfl1Q2VPR5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms