Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Chrna5Q2MKA5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Chrna5Q2MKA5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Chrna5Q2MKA5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Chrna5Q2MKA5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Chrna5Q2MKA5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Chrna5Q2MKA5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chrna5Q2MKA5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chrna5Q2MKA5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chrna5Q2MKA5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chrna5Q2MKA5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chrna5Q2MKA5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chrna5Q2MKA5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chrna5Q2MKA5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chrna5Q2MKA5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chrna5Q2MKA5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chrna5Q2MKA5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chrna5Q2MKA5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chrna5Q2MKA5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chrna5Q2MKA5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chrna5Q2MKA5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chrna5Q2MKA5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chrna5Q2MKA5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chrna5Q2MKA5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Chrna5Q2MKA5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chrna5Q2MKA5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Chrna5Q2MKA5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chrna5Q2MKA5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chrna5Q2MKA5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chrna5Q2MKA5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Chrna5Q2MKA5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chrna5Q2MKA5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chrna5Q2MKA5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chrna5Q2MKA5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Chrna5Q2MKA5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chrna5Q2MKA5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chrna5Q2MKA5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Chrna5Q2MKA5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chrna5Q2MKA5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chrna5Q2MKA5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chrna5Q2MKA5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chrna5Q2MKA5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chrna5Q2MKA5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chrna5Q2MKA5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chrna5Q2MKA5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chrna5Q2MKA5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chrna5Q2MKA5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chrna5Q2MKA5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chrna5Q2MKA5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chrna5Q2MKA5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chrna5Q2MKA5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chrna5Q2MKA5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Chrna5Q2MKA5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chrna5Q2MKA5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chrna5Q2MKA5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chrna5Q2MKA5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Chrna5Q2MKA5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chrna5Q2MKA5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chrna5Q2MKA5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chrna5Q2MKA5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Chrna5Q2MKA5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chrna5Q2MKA5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chrna5Q2MKA5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chrna5Q2MKA5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chrna5Q2MKA5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chrna5Q2MKA5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chrna5Q2MKA5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chrna5Q2MKA5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chrna5Q2MKA5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chrna5Q2MKA5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chrna5Q2MKA5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chrna5Q2MKA5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chrna5Q2MKA5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chrna5Q2MKA5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Chrna5Q2MKA5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chrna5Q2MKA5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chrna5Q2MKA5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chrna5Q2MKA5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chrna5Q2MKA5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chrna5Q2MKA5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chrna5Q2MKA5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chrna5Q2MKA5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chrna5Q2MKA5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Chrna5Q2MKA5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chrna5Q2MKA5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chrna5Q2MKA5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Chrna5Q2MKA5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Chrna5Q2MKA5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chrna5Q2MKA5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chrna5Q2MKA5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chrna5Q2MKA5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chrna5Q2MKA5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chrna5Q2MKA5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chrna5Q2MKA5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chrna5Q2MKA5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chrna5Q2MKA5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chrna5Q2MKA5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chrna5Q2MKA5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chrna5Q2MKA5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chrna5Q2MKA5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms