Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RelaQ04207 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RelaQ04207 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RelaQ04207 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RelaQ04207 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RelaQ04207 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RelaQ04207 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RelaQ04207 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RelaQ04207 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RelaQ04207 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RelaQ04207 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RelaQ04207 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RelaQ04207 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RelaQ04207 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RelaQ04207 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RelaQ04207 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RelaQ04207 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RelaQ04207 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RelaQ04207 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RelaQ04207 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RelaQ04207 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RelaQ04207 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RelaQ04207 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RelaQ04207 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RelaQ04207 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RelaQ04207 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RelaQ04207 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RelaQ04207 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RelaQ04207 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RelaQ04207 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RelaQ04207 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RelaQ04207 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RelaQ04207 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RelaQ04207 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RelaQ04207 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RelaQ04207 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RelaQ04207 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RelaQ04207 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RelaQ04207 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RelaQ04207 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RelaQ04207 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RelaQ04207 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RelaQ04207 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RelaQ04207 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RelaQ04207 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RelaQ04207 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RelaQ04207 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RelaQ04207 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RelaQ04207 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RelaQ04207 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RelaQ04207 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RelaQ04207 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RelaQ04207 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RelaQ04207 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RelaQ04207 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RelaQ04207 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RelaQ04207 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RelaQ04207 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RelaQ04207 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RelaQ04207 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RelaQ04207 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RelaQ04207 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RelaQ04207 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RelaQ04207 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RelaQ04207 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RelaQ04207 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RelaQ04207 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RelaQ04207 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RelaQ04207 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RelaQ04207 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RelaQ04207 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RelaQ04207 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RelaQ04207 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RelaQ04207 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RelaQ04207 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RelaQ04207 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RelaQ04207 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RelaQ04207 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RelaQ04207 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RelaQ04207 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RelaQ04207 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RelaQ04207 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RelaQ04207 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RelaQ04207 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RelaQ04207 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RelaQ04207 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RelaQ04207 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RelaQ04207 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RelaQ04207 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RelaQ04207 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RelaQ04207 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RelaQ04207 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RelaQ04207 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RelaQ04207 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RelaQ04207 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RelaQ04207 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RelaQ04207 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RelaQ04207 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RelaQ04207 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RelaQ04207 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms