Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cry1P97784 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cry1P97784 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cry1P97784 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cry1P97784 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cry1P97784 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cry1P97784 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cry1P97784 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cry1P97784 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cry1P97784 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cry1P97784 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Cry1P97784 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cry1P97784 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cry1P97784 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cry1P97784 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cry1P97784 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cry1P97784 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cry1P97784 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cry1P97784 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cry1P97784 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Cry1P97784 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cry1P97784 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cry1P97784 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cry1P97784 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cry1P97784 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cry1P97784 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cry1P97784 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cry1P97784 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cry1P97784 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cry1P97784 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cry1P97784 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cry1P97784 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cry1P97784 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cry1P97784 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cry1P97784 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cry1P97784 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cry1P97784 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cry1P97784 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cry1P97784 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cry1P97784 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cry1P97784 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cry1P97784 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cry1P97784 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cry1P97784 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cry1P97784 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cry1P97784 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cry1P97784 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cry1P97784 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Cry1P97784 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cry1P97784 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cry1P97784 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cry1P97784 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cry1P97784 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cry1P97784 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cry1P97784 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cry1P97784 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cry1P97784 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cry1P97784 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cry1P97784 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cry1P97784 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cry1P97784 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cry1P97784 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cry1P97784 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cry1P97784 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cry1P97784 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cry1P97784 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cry1P97784 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cry1P97784 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cry1P97784 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cry1P97784 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cry1P97784 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cry1P97784 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cry1P97784 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cry1P97784 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cry1P97784 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Cry1P97784 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cry1P97784 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cry1P97784 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cry1P97784 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cry1P97784 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cry1P97784 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cry1P97784 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cry1P97784 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cry1P97784 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cry1P97784 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Cry1P97784 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cry1P97784 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cry1P97784 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cry1P97784 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cry1P97784 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cry1P97784 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cry1P97784 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cry1P97784 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cry1P97784 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cry1P97784 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cry1P97784 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cry1P97784 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cry1P97784 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cry1P97784 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cry1P97784 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms