Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gabpb2P81069 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gabpb2P81069 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gabpb2P81069 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gabpb2P81069 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gabpb2P81069 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gabpb2P81069 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gabpb2P81069 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gabpb2P81069 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gabpb2P81069 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gabpb2P81069 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gabpb2P81069 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gabpb2P81069 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gabpb2P81069 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gabpb2P81069 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gabpb2P81069 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gabpb2P81069 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gabpb2P81069 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gabpb2P81069 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gabpb2P81069 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gabpb2P81069 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gabpb2P81069 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gabpb2P81069 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Gabpb2P81069 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gabpb2P81069 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Gabpb2P81069 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gabpb2P81069 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gabpb2P81069 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gabpb2P81069 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gabpb2P81069 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gabpb2P81069 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gabpb2P81069 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gabpb2P81069 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gabpb2P81069 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Gabpb2P81069 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gabpb2P81069 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gabpb2P81069 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gabpb2P81069 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gabpb2P81069 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gabpb2P81069 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gabpb2P81069 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gabpb2P81069 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gabpb2P81069 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gabpb2P81069 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gabpb2P81069 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gabpb2P81069 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gabpb2P81069 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gabpb2P81069 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gabpb2P81069 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gabpb2P81069 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gabpb2P81069 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Gabpb2P81069 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gabpb2P81069 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gabpb2P81069 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gabpb2P81069 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gabpb2P81069 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gabpb2P81069 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gabpb2P81069 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gabpb2P81069 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gabpb2P81069 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gabpb2P81069 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gabpb2P81069 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gabpb2P81069 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gabpb2P81069 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gabpb2P81069 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gabpb2P81069 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gabpb2P81069 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gabpb2P81069 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gabpb2P81069 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gabpb2P81069 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gabpb2P81069 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gabpb2P81069 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gabpb2P81069 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Gabpb2P81069 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gabpb2P81069 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gabpb2P81069 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gabpb2P81069 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gabpb2P81069 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gabpb2P81069 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gabpb2P81069 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gabpb2P81069 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gabpb2P81069 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gabpb2P81069 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gabpb2P81069 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gabpb2P81069 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gabpb2P81069 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gabpb2P81069 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gabpb2P81069 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gabpb2P81069 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gabpb2P81069 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gabpb2P81069 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Gabpb2P81069 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gabpb2P81069 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gabpb2P81069 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gabpb2P81069 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Gabpb2P81069 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gabpb2P81069 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gabpb2P81069 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gabpb2P81069 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gabpb2P81069 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms