Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SbdsP70122 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SbdsP70122 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SbdsP70122 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SbdsP70122 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SbdsP70122 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SbdsP70122 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SbdsP70122 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SbdsP70122 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SbdsP70122 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SbdsP70122 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SbdsP70122 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SbdsP70122 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SbdsP70122 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SbdsP70122 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SbdsP70122 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SbdsP70122 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SbdsP70122 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SbdsP70122 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SbdsP70122 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SbdsP70122 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SbdsP70122 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SbdsP70122 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SbdsP70122 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SbdsP70122 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SbdsP70122 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SbdsP70122 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SbdsP70122 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SbdsP70122 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SbdsP70122 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SbdsP70122 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SbdsP70122 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SbdsP70122 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SbdsP70122 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SbdsP70122 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SbdsP70122 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SbdsP70122 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SbdsP70122 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SbdsP70122 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SbdsP70122 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SbdsP70122 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SbdsP70122 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SbdsP70122 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SbdsP70122 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SbdsP70122 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SbdsP70122 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SbdsP70122 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SbdsP70122 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SbdsP70122 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SbdsP70122 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SbdsP70122 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SbdsP70122 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SbdsP70122 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SbdsP70122 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SbdsP70122 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SbdsP70122 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SbdsP70122 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SbdsP70122 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SbdsP70122 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SbdsP70122 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SbdsP70122 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SbdsP70122 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SbdsP70122 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SbdsP70122 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SbdsP70122 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SbdsP70122 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SbdsP70122 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SbdsP70122 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SbdsP70122 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SbdsP70122 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SbdsP70122 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SbdsP70122 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SbdsP70122 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SbdsP70122 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SbdsP70122 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SbdsP70122 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SbdsP70122 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SbdsP70122 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SbdsP70122 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SbdsP70122 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SbdsP70122 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SbdsP70122 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SbdsP70122 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SbdsP70122 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SbdsP70122 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SbdsP70122 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SbdsP70122 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SbdsP70122 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SbdsP70122 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SbdsP70122 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SbdsP70122 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SbdsP70122 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SbdsP70122 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SbdsP70122 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SbdsP70122 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SbdsP70122 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SbdsP70122 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SbdsP70122 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SbdsP70122 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SbdsP70122 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms