Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ufm1P61961 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ufm1P61961 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ufm1P61961 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ufm1P61961 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ufm1P61961 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ufm1P61961 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ufm1P61961 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ufm1P61961 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ufm1P61961 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ufm1P61961 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ufm1P61961 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ufm1P61961 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ufm1P61961 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ufm1P61961 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ufm1P61961 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ufm1P61961 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ufm1P61961 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ufm1P61961 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ufm1P61961 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ufm1P61961 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ufm1P61961 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ufm1P61961 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ufm1P61961 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ufm1P61961 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ufm1P61961 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ufm1P61961 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ufm1P61961 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ufm1P61961 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ufm1P61961 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ufm1P61961 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ufm1P61961 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ufm1P61961 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ufm1P61961 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ufm1P61961 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ufm1P61961 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ufm1P61961 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ufm1P61961 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ufm1P61961 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ufm1P61961 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ufm1P61961 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ufm1P61961 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ufm1P61961 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ufm1P61961 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ufm1P61961 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ufm1P61961 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ufm1P61961 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ufm1P61961 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ufm1P61961 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ufm1P61961 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ufm1P61961 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ufm1P61961 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ufm1P61961 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ufm1P61961 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ufm1P61961 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ufm1P61961 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ufm1P61961 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ufm1P61961 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ufm1P61961 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ufm1P61961 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ufm1P61961 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ufm1P61961 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ufm1P61961 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ufm1P61961 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ufm1P61961 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ufm1P61961 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ufm1P61961 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ufm1P61961 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ufm1P61961 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ufm1P61961 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ufm1P61961 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ufm1P61961 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ufm1P61961 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ufm1P61961 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ufm1P61961 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ufm1P61961 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ufm1P61961 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ufm1P61961 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ufm1P61961 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ufm1P61961 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ufm1P61961 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ufm1P61961 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ufm1P61961 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ufm1P61961 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ufm1P61961 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ufm1P61961 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ufm1P61961 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ufm1P61961 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ufm1P61961 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ufm1P61961 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ufm1P61961 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ufm1P61961 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ufm1P61961 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ufm1P61961 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ufm1P61961 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ufm1P61961 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ufm1P61961 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ufm1P61961 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ufm1P61961 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ufm1P61961 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms