Protein–RNA interactions for Protein: P58749

Tm6sf1, Transmembrane 6 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm6sf1P58749 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tm6sf1P58749 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tm6sf1P58749 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tm6sf1P58749 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tm6sf1P58749 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tm6sf1P58749 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tm6sf1P58749 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tm6sf1P58749 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tm6sf1P58749 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tm6sf1P58749 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tm6sf1P58749 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tm6sf1P58749 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tm6sf1P58749 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tm6sf1P58749 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tm6sf1P58749 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tm6sf1P58749 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tm6sf1P58749 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tm6sf1P58749 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tm6sf1P58749 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tm6sf1P58749 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tm6sf1P58749 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tm6sf1P58749 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tm6sf1P58749 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tm6sf1P58749 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tm6sf1P58749 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tm6sf1P58749 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tm6sf1P58749 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tm6sf1P58749 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tm6sf1P58749 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tm6sf1P58749 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tm6sf1P58749 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tm6sf1P58749 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tm6sf1P58749 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tm6sf1P58749 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tm6sf1P58749 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Tm6sf1P58749 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tm6sf1P58749 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Tm6sf1P58749 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tm6sf1P58749 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tm6sf1P58749 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tm6sf1P58749 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tm6sf1P58749 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tm6sf1P58749 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tm6sf1P58749 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tm6sf1P58749 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tm6sf1P58749 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tm6sf1P58749 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tm6sf1P58749 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tm6sf1P58749 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tm6sf1P58749 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Tm6sf1P58749 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Tm6sf1P58749 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tm6sf1P58749 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Tm6sf1P58749 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tm6sf1P58749 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tm6sf1P58749 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tm6sf1P58749 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tm6sf1P58749 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Tm6sf1P58749 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Tm6sf1P58749 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tm6sf1P58749 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tm6sf1P58749 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tm6sf1P58749 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tm6sf1P58749 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tm6sf1P58749 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tm6sf1P58749 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tm6sf1P58749 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tm6sf1P58749 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tm6sf1P58749 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tm6sf1P58749 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tm6sf1P58749 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tm6sf1P58749 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Tm6sf1P58749 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tm6sf1P58749 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tm6sf1P58749 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tm6sf1P58749 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tm6sf1P58749 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tm6sf1P58749 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tm6sf1P58749 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tm6sf1P58749 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tm6sf1P58749 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tm6sf1P58749 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tm6sf1P58749 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tm6sf1P58749 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tm6sf1P58749 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tm6sf1P58749 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tm6sf1P58749 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tm6sf1P58749 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tm6sf1P58749 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tm6sf1P58749 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tm6sf1P58749 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tm6sf1P58749 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Tm6sf1P58749 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tm6sf1P58749 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tm6sf1P58749 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tm6sf1P58749 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tm6sf1P58749 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tm6sf1P58749 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tm6sf1P58749 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tm6sf1P58749 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms