Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Snrpa1P57784 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Snrpa1P57784 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Snrpa1P57784 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Snrpa1P57784 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Snrpa1P57784 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Snrpa1P57784 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Snrpa1P57784 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Snrpa1P57784 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Snrpa1P57784 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Snrpa1P57784 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Snrpa1P57784 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Snrpa1P57784 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snrpa1P57784 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snrpa1P57784 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snrpa1P57784 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snrpa1P57784 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Snrpa1P57784 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Snrpa1P57784 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Snrpa1P57784 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snrpa1P57784 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snrpa1P57784 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snrpa1P57784 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snrpa1P57784 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snrpa1P57784 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snrpa1P57784 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snrpa1P57784 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snrpa1P57784 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snrpa1P57784 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Snrpa1P57784 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Snrpa1P57784 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Snrpa1P57784 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Snrpa1P57784 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Snrpa1P57784 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Snrpa1P57784 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Snrpa1P57784 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Snrpa1P57784 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Snrpa1P57784 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Snrpa1P57784 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Snrpa1P57784 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Snrpa1P57784 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snrpa1P57784 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snrpa1P57784 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snrpa1P57784 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snrpa1P57784 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Snrpa1P57784 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snrpa1P57784 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snrpa1P57784 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snrpa1P57784 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Snrpa1P57784 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Snrpa1P57784 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Snrpa1P57784 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Snrpa1P57784 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Snrpa1P57784 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Snrpa1P57784 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Snrpa1P57784 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Snrpa1P57784 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Snrpa1P57784 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Snrpa1P57784 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snrpa1P57784 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snrpa1P57784 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snrpa1P57784 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snrpa1P57784 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snrpa1P57784 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snrpa1P57784 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Snrpa1P57784 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Snrpa1P57784 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Snrpa1P57784 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Snrpa1P57784 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Snrpa1P57784 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snrpa1P57784 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snrpa1P57784 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snrpa1P57784 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snrpa1P57784 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snrpa1P57784 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snrpa1P57784 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snrpa1P57784 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Snrpa1P57784 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Snrpa1P57784 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Snrpa1P57784 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Snrpa1P57784 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snrpa1P57784 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snrpa1P57784 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snrpa1P57784 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snrpa1P57784 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snrpa1P57784 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snrpa1P57784 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snrpa1P57784 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snrpa1P57784 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Snrpa1P57784 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snrpa1P57784 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snrpa1P57784 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snrpa1P57784 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snrpa1P57784 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snrpa1P57784 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snrpa1P57784 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snrpa1P57784 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snrpa1P57784 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snrpa1P57784 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snrpa1P57784 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms