Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gp1bbP56400 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gp1bbP56400 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gp1bbP56400 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gp1bbP56400 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gp1bbP56400 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gp1bbP56400 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gp1bbP56400 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gp1bbP56400 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gp1bbP56400 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gp1bbP56400 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gp1bbP56400 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Gp1bbP56400 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gp1bbP56400 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gp1bbP56400 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Gp1bbP56400 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gp1bbP56400 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gp1bbP56400 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gp1bbP56400 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gp1bbP56400 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gp1bbP56400 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gp1bbP56400 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gp1bbP56400 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gp1bbP56400 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gp1bbP56400 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gp1bbP56400 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gp1bbP56400 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gp1bbP56400 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gp1bbP56400 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gp1bbP56400 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gp1bbP56400 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gp1bbP56400 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gp1bbP56400 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gp1bbP56400 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gp1bbP56400 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gp1bbP56400 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gp1bbP56400 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gp1bbP56400 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gp1bbP56400 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gp1bbP56400 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gp1bbP56400 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gp1bbP56400 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gp1bbP56400 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gp1bbP56400 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gp1bbP56400 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gp1bbP56400 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gp1bbP56400 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gp1bbP56400 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gp1bbP56400 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gp1bbP56400 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gp1bbP56400 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gp1bbP56400 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gp1bbP56400 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gp1bbP56400 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gp1bbP56400 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gp1bbP56400 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gp1bbP56400 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gp1bbP56400 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gp1bbP56400 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gp1bbP56400 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gp1bbP56400 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gp1bbP56400 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gp1bbP56400 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gp1bbP56400 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gp1bbP56400 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gp1bbP56400 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gp1bbP56400 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gp1bbP56400 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gp1bbP56400 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gp1bbP56400 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gp1bbP56400 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gp1bbP56400 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gp1bbP56400 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gp1bbP56400 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gp1bbP56400 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gp1bbP56400 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gp1bbP56400 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gp1bbP56400 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gp1bbP56400 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gp1bbP56400 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gp1bbP56400 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gp1bbP56400 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gp1bbP56400 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gp1bbP56400 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gp1bbP56400 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gp1bbP56400 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gp1bbP56400 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gp1bbP56400 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gp1bbP56400 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gp1bbP56400 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gp1bbP56400 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gp1bbP56400 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gp1bbP56400 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gp1bbP56400 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gp1bbP56400 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gp1bbP56400 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Gp1bbP56400 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gp1bbP56400 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gp1bbP56400 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gp1bbP56400 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms