Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Traf1P39428 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Traf1P39428 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Traf1P39428 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Traf1P39428 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Traf1P39428 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Traf1P39428 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Traf1P39428 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Traf1P39428 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Traf1P39428 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Traf1P39428 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Traf1P39428 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Traf1P39428 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Traf1P39428 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Traf1P39428 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Traf1P39428 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Traf1P39428 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Traf1P39428 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Traf1P39428 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Traf1P39428 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Traf1P39428 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Traf1P39428 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Traf1P39428 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Traf1P39428 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Traf1P39428 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Traf1P39428 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Traf1P39428 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Traf1P39428 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Traf1P39428 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Traf1P39428 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Traf1P39428 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Traf1P39428 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Traf1P39428 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Traf1P39428 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Traf1P39428 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Traf1P39428 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Traf1P39428 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Traf1P39428 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Traf1P39428 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Traf1P39428 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Traf1P39428 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Traf1P39428 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Traf1P39428 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Traf1P39428 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Traf1P39428 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Traf1P39428 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Traf1P39428 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Traf1P39428 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Traf1P39428 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Traf1P39428 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Traf1P39428 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Traf1P39428 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Traf1P39428 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Traf1P39428 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Traf1P39428 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Traf1P39428 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Traf1P39428 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Traf1P39428 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Traf1P39428 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Traf1P39428 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Traf1P39428 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Traf1P39428 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Traf1P39428 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Traf1P39428 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Traf1P39428 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Traf1P39428 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Traf1P39428 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Traf1P39428 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Traf1P39428 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Traf1P39428 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Traf1P39428 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Traf1P39428 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Traf1P39428 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Traf1P39428 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Traf1P39428 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Traf1P39428 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Traf1P39428 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Traf1P39428 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Traf1P39428 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Traf1P39428 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Traf1P39428 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Traf1P39428 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Traf1P39428 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Traf1P39428 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Traf1P39428 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Traf1P39428 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Traf1P39428 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Traf1P39428 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Traf1P39428 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Traf1P39428 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Traf1P39428 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Traf1P39428 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Traf1P39428 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Traf1P39428 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Traf1P39428 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Traf1P39428 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Traf1P39428 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Traf1P39428 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Traf1P39428 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Traf1P39428 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms