Protein–RNA interactions for Protein: P21440

Abcb4, Phosphatidylcholine translocator ABCB4, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb4P21440 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcb4P21440 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcb4P21440 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcb4P21440 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcb4P21440 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcb4P21440 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcb4P21440 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcb4P21440 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcb4P21440 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcb4P21440 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcb4P21440 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcb4P21440 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcb4P21440 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcb4P21440 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcb4P21440 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcb4P21440 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcb4P21440 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcb4P21440 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcb4P21440 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcb4P21440 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abcb4P21440 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abcb4P21440 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abcb4P21440 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abcb4P21440 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abcb4P21440 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abcb4P21440 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcb4P21440 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcb4P21440 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcb4P21440 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcb4P21440 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcb4P21440 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcb4P21440 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcb4P21440 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcb4P21440 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcb4P21440 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcb4P21440 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcb4P21440 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcb4P21440 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcb4P21440 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcb4P21440 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcb4P21440 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcb4P21440 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcb4P21440 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcb4P21440 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcb4P21440 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcb4P21440 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcb4P21440 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcb4P21440 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcb4P21440 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcb4P21440 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcb4P21440 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcb4P21440 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Abcb4P21440 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Abcb4P21440 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Abcb4P21440 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Abcb4P21440 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Abcb4P21440 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Abcb4P21440 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Abcb4P21440 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Abcb4P21440 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Abcb4P21440 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Abcb4P21440 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcb4P21440 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcb4P21440 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcb4P21440 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcb4P21440 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcb4P21440 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcb4P21440 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcb4P21440 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcb4P21440 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abcb4P21440 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abcb4P21440 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abcb4P21440 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abcb4P21440 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abcb4P21440 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Abcb4P21440 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abcb4P21440 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abcb4P21440 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abcb4P21440 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abcb4P21440 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abcb4P21440 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abcb4P21440 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abcb4P21440 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Abcb4P21440 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abcb4P21440 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abcb4P21440 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abcb4P21440 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abcb4P21440 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abcb4P21440 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abcb4P21440 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abcb4P21440 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcb4P21440 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcb4P21440 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcb4P21440 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcb4P21440 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcb4P21440 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcb4P21440 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcb4P21440 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcb4P21440 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcb4P21440 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms