Protein–RNA interactions for Protein: P08121

Col3a1, Collagen alpha-1(III) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col3a1P08121 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col3a1P08121 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col3a1P08121 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col3a1P08121 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col3a1P08121 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col3a1P08121 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col3a1P08121 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Col3a1P08121 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col3a1P08121 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col3a1P08121 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col3a1P08121 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col3a1P08121 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Col3a1P08121 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Col3a1P08121 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Col3a1P08121 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Col3a1P08121 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Col3a1P08121 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Col3a1P08121 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Col3a1P08121 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Col3a1P08121 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Col3a1P08121 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col3a1P08121 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col3a1P08121 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col3a1P08121 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col3a1P08121 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Col3a1P08121 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col3a1P08121 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col3a1P08121 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col3a1P08121 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col3a1P08121 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col3a1P08121 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col3a1P08121 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col3a1P08121 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col3a1P08121 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col3a1P08121 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col3a1P08121 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col3a1P08121 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col3a1P08121 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col3a1P08121 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Col3a1P08121 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Col3a1P08121 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Col3a1P08121 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col3a1P08121 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col3a1P08121 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col3a1P08121 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col3a1P08121 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col3a1P08121 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col3a1P08121 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col3a1P08121 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col3a1P08121 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col3a1P08121 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Col3a1P08121 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col3a1P08121 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col3a1P08121 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col3a1P08121 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col3a1P08121 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col3a1P08121 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col3a1P08121 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col3a1P08121 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col3a1P08121 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col3a1P08121 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col3a1P08121 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col3a1P08121 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col3a1P08121 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col3a1P08121 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col3a1P08121 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col3a1P08121 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Col3a1P08121 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col3a1P08121 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col3a1P08121 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col3a1P08121 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col3a1P08121 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col3a1P08121 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col3a1P08121 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col3a1P08121 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col3a1P08121 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col3a1P08121 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col3a1P08121 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col3a1P08121 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col3a1P08121 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Col3a1P08121 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col3a1P08121 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Col3a1P08121 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Col3a1P08121 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Col3a1P08121 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Col3a1P08121 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Col3a1P08121 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Col3a1P08121 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Col3a1P08121 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Col3a1P08121 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col3a1P08121 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col3a1P08121 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col3a1P08121 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col3a1P08121 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col3a1P08121 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col3a1P08121 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col3a1P08121 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col3a1P08121 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col3a1P08121 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col3a1P08121 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms