Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spta1P08032 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spta1P08032 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spta1P08032 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spta1P08032 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spta1P08032 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spta1P08032 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spta1P08032 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spta1P08032 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spta1P08032 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spta1P08032 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spta1P08032 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Spta1P08032 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spta1P08032 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spta1P08032 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spta1P08032 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spta1P08032 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spta1P08032 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spta1P08032 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spta1P08032 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spta1P08032 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spta1P08032 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spta1P08032 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Spta1P08032 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spta1P08032 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spta1P08032 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spta1P08032 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spta1P08032 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spta1P08032 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spta1P08032 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spta1P08032 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spta1P08032 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spta1P08032 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spta1P08032 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spta1P08032 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spta1P08032 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spta1P08032 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spta1P08032 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spta1P08032 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spta1P08032 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spta1P08032 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spta1P08032 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spta1P08032 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Spta1P08032 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spta1P08032 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spta1P08032 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spta1P08032 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spta1P08032 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spta1P08032 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spta1P08032 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Spta1P08032 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Spta1P08032 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Spta1P08032 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Spta1P08032 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Spta1P08032 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Spta1P08032 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Spta1P08032 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Spta1P08032 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Spta1P08032 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Spta1P08032 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Spta1P08032 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Spta1P08032 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Spta1P08032 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Spta1P08032 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Spta1P08032 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Spta1P08032 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Spta1P08032 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Spta1P08032 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Spta1P08032 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Spta1P08032 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Spta1P08032 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Spta1P08032 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Spta1P08032 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Spta1P08032 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Spta1P08032 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Spta1P08032 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Spta1P08032 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spta1P08032 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spta1P08032 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spta1P08032 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spta1P08032 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spta1P08032 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spta1P08032 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spta1P08032 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spta1P08032 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spta1P08032 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spta1P08032 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spta1P08032 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spta1P08032 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spta1P08032 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spta1P08032 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Spta1P08032 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spta1P08032 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spta1P08032 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spta1P08032 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spta1P08032 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spta1P08032 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spta1P08032 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Spta1P08032 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Spta1P08032 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms