Protein–RNA interactions for Protein: P00397

Mtco1, Cytochrome c oxidase subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtco1P00397 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mtco1P00397 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mtco1P00397 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mtco1P00397 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mtco1P00397 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mtco1P00397 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Mtco1P00397 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mtco1P00397 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mtco1P00397 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Mtco1P00397 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mtco1P00397 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mtco1P00397 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mtco1P00397 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mtco1P00397 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mtco1P00397 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mtco1P00397 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mtco1P00397 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mtco1P00397 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mtco1P00397 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mtco1P00397 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mtco1P00397 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mtco1P00397 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mtco1P00397 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mtco1P00397 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mtco1P00397 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mtco1P00397 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mtco1P00397 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mtco1P00397 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mtco1P00397 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mtco1P00397 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Mtco1P00397 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mtco1P00397 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mtco1P00397 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mtco1P00397 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mtco1P00397 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Mtco1P00397 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mtco1P00397 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mtco1P00397 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mtco1P00397 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mtco1P00397 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mtco1P00397 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mtco1P00397 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mtco1P00397 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mtco1P00397 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mtco1P00397 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mtco1P00397 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mtco1P00397 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mtco1P00397 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mtco1P00397 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Mtco1P00397 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mtco1P00397 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mtco1P00397 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mtco1P00397 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mtco1P00397 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mtco1P00397 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mtco1P00397 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Mtco1P00397 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mtco1P00397 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mtco1P00397 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mtco1P00397 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mtco1P00397 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mtco1P00397 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mtco1P00397 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mtco1P00397 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mtco1P00397 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Mtco1P00397 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mtco1P00397 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Mtco1P00397 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Mtco1P00397 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mtco1P00397 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mtco1P00397 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mtco1P00397 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mtco1P00397 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mtco1P00397 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mtco1P00397 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mtco1P00397 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mtco1P00397 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mtco1P00397 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mtco1P00397 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mtco1P00397 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mtco1P00397 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mtco1P00397 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mtco1P00397 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mtco1P00397 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mtco1P00397 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mtco1P00397 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mtco1P00397 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mtco1P00397 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mtco1P00397 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mtco1P00397 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mtco1P00397 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mtco1P00397 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mtco1P00397 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mtco1P00397 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mtco1P00397 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mtco1P00397 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mtco1P00397 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mtco1P00397 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mtco1P00397 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mtco1P00397 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms