Protein–RNA interactions for Protein: O88978

Lrrc6, Protein tilB homolog, mousemouse

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc6O88978 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrc6O88978 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrc6O88978 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrc6O88978 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrc6O88978 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrc6O88978 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrc6O88978 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrc6O88978 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrc6O88978 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrc6O88978 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrc6O88978 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrc6O88978 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrc6O88978 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrc6O88978 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrc6O88978 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrc6O88978 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrc6O88978 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrc6O88978 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrc6O88978 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrc6O88978 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc6O88978 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc6O88978 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc6O88978 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc6O88978 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc6O88978 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc6O88978 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc6O88978 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc6O88978 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc6O88978 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc6O88978 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc6O88978 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc6O88978 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrc6O88978 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrc6O88978 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrc6O88978 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrc6O88978 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrc6O88978 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrc6O88978 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrc6O88978 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrc6O88978 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrc6O88978 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrc6O88978 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrc6O88978 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrc6O88978 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrc6O88978 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lrrc6O88978 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrc6O88978 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrc6O88978 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrc6O88978 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrc6O88978 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrc6O88978 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrc6O88978 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrc6O88978 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc6O88978 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc6O88978 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc6O88978 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc6O88978 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc6O88978 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc6O88978 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc6O88978 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc6O88978 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc6O88978 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc6O88978 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc6O88978 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc6O88978 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc6O88978 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc6O88978 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc6O88978 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc6O88978 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc6O88978 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc6O88978 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc6O88978 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc6O88978 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc6O88978 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc6O88978 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc6O88978 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc6O88978 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc6O88978 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc6O88978 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrc6O88978 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrc6O88978 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrc6O88978 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrc6O88978 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc6O88978 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc6O88978 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc6O88978 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc6O88978 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc6O88978 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc6O88978 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc6O88978 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc6O88978 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc6O88978 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc6O88978 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Lrrc6O88978 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc6O88978 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc6O88978 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc6O88978 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc6O88978 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc6O88978 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc6O88978 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
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